1 / 12

Komputerowa analiza sieci genowych

Komputerowa analiza sieci genowych. Agnieszka Olszewska Jacek Ławrynowicz Promotor: prof. Krzysztof Giaro. Cele pracy. Poznanie metod analizy sieci Wytworzenie oprogramowania do komputerowej analizy sieci Analiza przykładowych sieci przy pomocy wytworzonego oprogramowania.

fadhila
Download Presentation

Komputerowa analiza sieci genowych

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Komputerowa analiza sieci genowych Agnieszka Olszewska Jacek Ławrynowicz Promotor: prof. Krzysztof Giaro

  2. Cele pracy • Poznanie metod analizy sieci • Wytworzenie oprogramowania do komputerowej analizy sieci • Analiza przykładowych sieci przy pomocy wytworzonego oprogramowania

  3. Analizowane sieci 1/2 • Sieci biologiczne: • Sieci regulacji genowych E. coli • Sieci oddziaływań białkowych H. pylori, C. elegans • Sztucznie wyewoluowane sieci regulacji genowych

  4. Analizowane sieci 2/2 • Sieci społeczne • Sieci technologiczne • Sieci losowe: • Model Erdős-Rényi • Model Barabási-Albert • Model małego świata • Graf Kroneckera

  5. Parametry sieci • Poziomy analizy sieci: • Pojedyncza sieć • Populacja sieci • Zbiór populacji sieci • Parametry skalarne, wektorowe, statystyczne

  6. Parametry – pojedyncza sieć • Stopień wierzchołka (rozkład)

  7. Parametry – pojedyncza sieć • Współczynnik klasteryzacji • Rozkład – Średnia • 0,02 – GRN E. coli • 0,28 – sieć BA

  8. Parametry - pojedyncza sieć • Współczynnik selektywności

  9. Parametry – zbiór populacji • Średnica • Ścieżka charakterystyczna

  10. Parametry – zbiór populacji • Współczynnik selektywności • Współczynnik klasteryzacji

  11. Porównywanie sieci • Porównywanie parametrów sieci

  12. Porównywanie sieci • Graflety • Rozkłady stopni grafletów • Wartości średnie • Ocena metody

More Related