PubMed: Recherche, affichage, téléchargement et envoi par e-mail
This presentation is the property of its rightful owner.
Sponsored Links
1 / 49

PubMed: Recherche, affichage, téléchargement et envoi par e-mail (module 4.1) PowerPoint PPT Presentation


  • 48 Views
  • Uploaded on
  • Presentation posted in: General

PubMed: Recherche, affichage, téléchargement et envoi par e-mail (module 4.1). MODULE 4.1 PubMed: Recherche, affichage, téléchargement et envoi par e-mail. Instructions – Cette partie du:

Download Presentation

PubMed: Recherche, affichage, téléchargement et envoi par e-mail (module 4.1)

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Presentation Transcript


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

PubMed: Recherche, affichage, téléchargement et envoi par e-mail(module 4.1)


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

MODULE 4.1PubMed: Recherche, affichage, téléchargement et envoi par e-mail

Instructions – Cette partie du:

  • Cours est une présentation PowerPoint destinée à vous introduire à la recherche, l'affichage, le téléchargement et 'envoi par couurier électronique (e-mail sur PubMed);

  • module est hors connexion et est conçue comme source d'informations et de référence.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Table des Matières

  • Connexion à PubMed

  • Navigation sur PubMed

  • Sélection d'une base de données

  • Recherchesur PubMed

  • Options d'affichage

  • Options d'impression, sauvegarde et e-mail


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Avant d'aller à PubMed, vousdevezvousconnecter au site web de HINARI à l'adresse http://www.who.int/hinari/fr/


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Vous devez taper votre Nom d'utilisateur et votre mot de passe dans les boîtes appropriées, puis cliquer le bouton Login (Se connecter).

NB: Si vous ne vous connectez pas correctement, vous n'aurez pas accès aux articles en texte intégral


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Rappelez-vous que si vous n'utilisez pas la page de Login (Connexion), vous pouvez le faire sur la page Périodiques, base de données et autres sources d'informations en texte intégral.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Quand vous êtes connecté à partir de la page d'accueil de HINARI, accédez à PubMed en cliquant

Rechercher des articles avec PubMed (Medline).


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Depuis Octobre 2009, l'affichage de PubMed a été repensé d'une manière plus simple et plus intuitive.

Rappelez-vous d’accéder à PubMed à travers HINARI, sinon vous ne pourrez pas consulter les articles en texte intégral


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

La partie inférieure de la page d'accueil de PubMed affichée ici contient des liens hypertexte vers de nombreux outils et bases de données le National Center for Biotechnology Information (NCBI/Centre National d'informations de Biotechnologie).

Remarquez l'option Bookshelf (Étagère à livres) qui vous donne accès à de nombreux livres électroniques en texte intégral.

ᄇ²


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

La page Bookshelf de NCBI donne accès à plus de 700 ressources électroniques en sciences de la vie et en soins de santé, comprenant livres, collections d'articles, bases de données, documentation et rapports.

Remarquez les listes New & Updated (Nouveau et Actualisé) etFeatured Titles (Titres en vedette). Nous allons choisir l'option Browse Titles (Parcourir les titres).


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Dans le Bookshelf de NCBI, vous pouvez faire des recherches par Type de publication, Sujet ou Editeur (Types, subjects, publishers). Vous pouvez également effectuer unerecherche par mots-clés (Search).

Si vous cliquez sur Book dans Types, vous aurez accès à 136 livres.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

La boîte de recherche de PubMed est active. Mettez vos termes de recherche dans cette boîte.

Dans cet exemple, pour effectuer une recherche sur malaria infections AND Africa, tapez ces termes dans la boîte de requête, puis cliquez le bouton Search (Rechercher).


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Les résultats de la recherche sont affichés dans le corps de la page au format Summary (Sommaire), 20 Items per Page (20 éléments par page) avec l'option de tri (Sort by) Recently Added (récemment ajoutés). Ce sont là les options par défaut après une recherche.

Notez les deux filtres supplémentaires pour les articles Free Full Text (Texte intégral gratuit) et HINARI. Ceux -ci ont été créés par les recherches HINARI/PubMed sauvegardées dans My NCBI (Voir Module 4.5).

Sur les 4095 articles, 1920 sont disponibles sous le filtre HINARI et 1624 avec le filtre Free full text (avec quelques chevauchements).


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Notez l'hyperlien pour Free article (Article gratuit). En le cliquant, vous serez redirigé sur l'affichage Abstract (Résumé) et aurez accès au texte intégral.

Notez aussi que les termes de recherche – malaria, infections et Africa - sont en gras s'ils font partie du titre.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

A partir de l'affichage Abstract, cliquez le lien hypertexte vers le site de l'éditeur et l'article en texte intégral.

Pour les articles HINARI, il y aura des icônes HINARI et des liens.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Ici vous avez accès au texte intégral d'un article du Bulletin de l'Organisation Mondiale de la Santé.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Nous allons à présent utiliser le menu déroulant Display Settings (Options d'affichage) pour choisir le FormatAbstract, 20 éléments par page (Items per page) triés par les plus récemment ajoutés (Sort by Recently Added). Pour activer ces options, cliquez le bouton Apply (Appliquer).


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Notez que les options FormatAbstractavec20 Items per page et Sorted by Recently Added sont maintenant indiquées dans la ligne Display Settings au dessus du nombre de résultats.

Notez aussi les filtres Free Full Text et HINARI. Nous allons à présent cliquer sur celui de HINARI.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Quand vous cliquez sur l’icôneHINARI dans l'affichage Abstract, uneliste de les articles HINARI apparaît avec l’icôneHINARI. En cliquant sur cette icône, vous afficherez le texte intégral de l'article. Le filtre Free Full Text fonctionne de la même manière.

Notez que certains articles ont à la fois l’icône HINARI et Free Full Text icons dans l'affichage Abstract.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Depuis Août 2010, PubMed a amélioré l'affichage Abstract. Pour des résumés structurés, les sous-titres clés (INTRODUCTION, RESULTS, CONCLUSIONS)sont indiqués au début de chaque paragraphe. Notez aussi que les termes MeSH (Medical Subject Headings/Titres de sujets médicaux) sont en gras. Environ 25% des citations dans PubMed utilisent ce format.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Nous avons accédé à l'article en texte intégral en utilisant l’icône HINARI à partir de l'affichage Abstract.

Notez que vous pouvez télécharger l'article en tant que fichier PDF ou XML, ou imprimer le document.

Rappelez-vous que vous devez être correctement connecté à HINARI pour avoir accès au texte intégral des articles.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Au bas de chaque citation dans le formatAbstract, des informations sur les types de publications (Publication Types), les termes MeSH et les boursesderecherche (Grant Support) peuvent être affichées. Cliquez sur le menu déroulant pour voir ces informations.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Voici à présent le menu déroulant Display Settings(Options d'affichage) pour le formatMedline, 20 ItemsperPagetrié parRecentlyAdded. Cliquez le bouton Apply pour appliquer.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Notez la liste de termes Medical Subject Headings (MeSH) dans l'option Medline. Ces termes MeSH sont affectés par la National Library of Medicine (États Unis) pour l'indexation dans PubMed. Ils peuvent être utilisés pour rendre les recherches plus générales ou plus précises.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Nous voyons maintenant le menu déroulant Display Settings pour les options FormatSummary, 200 Items per Pagetriés parRecently Added. Pour activer ces options, cliquez le bouton Apply.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Le nombre de citations affichées, plus grand dans cette option d'affichage, est utile dans les situations de basse vitesse connexion.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Voici le menu déroulantDisplay Settings pour les options FormatAbstract, 50 Items per Page triés parTitle (titre).


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Sous l'option Sort by Title (Trier par titre), cette liste de citations commence par un A.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Dans le menu déroulant Send To (Envoyer vers), nous pouvons choisir parmi les options File (Fichier), Collections, Order (Commande), Clipboard (Presse-papiers) ou E-mail.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Vous devez cocher les cases à gauche des citations que vous voulez envoyer vers les options File, Collections, Order, Clipboard ou E-mail.

Si vous ne mettez pas de coches dans les cases de votre choix, les résultats de la recherche seront envoyés dans leur totalité vers l'option que vous aurez indiquée.

Notez que PubMed met à jour le nombre de citations que vous avez cochées.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Dans le menu déroulant Send To, cliquez sur le bouton Create File (créer le fichier), avec les options AbstractetPub Date (date de publication). Ceci sera un document à télécharger via votre navigateur Internet.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Le fichier pubmed_results se téléchargera au format .txt aubas de ce navigateur.Vous pourrez l'ouvrir avec le Bloc-Notes.

NB: Ce fichier est téléchargé via Mozilla Firefox. Dans d'autres navigateurs, la procédure et l'affichage peuvent différer


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Voici maintenant le texte d'un fichier .txt téléchargé et ouvert dansNotepad.

Vous pouvez sauvegarder ce fichier sur le disque dur C:/ , une clé USB ou un CD-ROM. Une fois sauvegardé, vous pouvez imprimer le document.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Dans le menu déroulant Send To, Nous avons choisi d'envoyer un fichier par E-mail, avec les options SummaryetRecently added. Ce document sera envoyé à l'adresse de courrier électronique que vous allez spécifier en tant que destinataire.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Juste en dessous du menu DisplaySettings, PubMed indique qu'un E-mail a été envoyé à l'adresse de courrier électronique destinataire que vous avez fournie.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Dans le menu déroulant Send To, nous avons choisi d'envoyer cinq citations au Clipboard (presse-papiers). Notez que seuls les cinq éléments cochés vont être envoyés.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Au cas où nous n'aurions pascochédecases de citations, les 500 premiers éléments seraient ajoutés au Clipboard.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

La coche verte confirme que 500 éléments ont été ajoutés au Clipboard.Il est aussi indiqué que les éléments du Clipboard seront perdus après 8 heures d'inactivité.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Sur la même page, une étiquette Item in clipboard (Element dans le presse-papiers) indique toutes les citations que vos avez choisi d'y mettre en cochant leurs cases.

Notez que le nombre d'éléments qui ont été envoyés au Clipboard est également indiqué.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Pour supprimer des éléments du Clipboard, cliquez sur Clipboard. Les résultats de la recherche seront ré-affichés et, grâce aux hyperliens qui leur ont été ajoutés, vous pourrez supprimer tous les éléments (Remove all items) ou individuellement certains d'entre eux (Remove from clipboard/Supprimer du clipboard). Dans le cas présent, nous allons vider le Clipboard (Remove all items.)


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Un message de confirmation indique que 500 éléments ont été supprimés du Clipboard.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Une autre fonctionnalité importante de PubMed est le Single Citation Matcher (Identificateur de citation unique). C'est un outil très utile quand vous connaissez l'auteur ou le titre de l'article que vous cherchez.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Sur la page du Single Citation Matcher, nous avons tapé aronson b dans la boîte Author name (Nom de l'auteur) et hinari dans la boîte Title words (Mots du titre). Cliquons ensuite le bouton Go.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

L'utilisation de ces termes dans le Single Citation Matcher a renvoyé 1 citation.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Nous avons répété cette recherche mais seulement pour l'auteur aronson b et exclu HINARI dans la boîte Titlewords. Le résultat de cette recherche plus générale est de 71 citations.

Notez qu'il est aussi indiqué qu'il y a au moins 14articles de cet auteur sur des sujets se rapportant à HINARI.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Depuis Avril 2010, PubMed a ajouté des liens vers des articles gratuits sur PubMed Central (PMC) et des livres et documents sur le Bookshelf de NCBI. A part les hyperliens Free Article, vous verrez aussi des liens Free text vers des livres et documents sur PMC.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Revenons à la page d'accueil de PubMed pour discuter brièvement des diverses ressources de formation de la liste Using PubMed (Utilisation de PubMed). Notez que ces ressources vont du Quick Start Guide (Guide de mise en route rapide) à la FAQs (Foire aux questions) en passant par de nombreux PubMed Tutorials (Didacticiels PubMed). Rappelez-vous que ces ressources sont destinées aux utilisateurs de PubMed en général, et non pas uniquement à PubMed/HINARI.


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

Nous avons accédé à la page PubMed Online Training (Formation PubMed en ligne). Il y a un lien vers un PubMed Tutorial (Didacticiel PubMed) détaillé et de nombreux Quick Tours (Visites guidées rapides) sur la recherche dans PubMed, la gestion des résultats, les termes MeSH et MY NCBI, en plus des Hot Topics (Sujets d'actualité).


Pubmed recherche affichage t l chargement et envoi par e mail module 4 1

A partir de la page d'accueil de PubMed, nous avons ouvert la page PubMed New and Noteworthy (Nouveau et Remarquable). C'est là l'emplacement des améliorations apportées à PubMed et My NCBI, qui donnent souvent lieu à des mises à jour du matériel de formation de HINARI/PubMed.

Fin du Module 4, Première Partie.

Un livret d'exercices accompagne cette partie du module. Il vous guidera à travers une séance en direct qui couvrira les points inclus dans cette présentation avec des exemples pratiques.

Mise à jour Décembre 2011


  • Login