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D. Jouffre, Thiam, S. Traoré, A. Caverivière, F. Domain, C. Inejih, G. Domalain.

La question de la comparaison intra-régionale des communautés de poissons démersaux d'Afrique de l'Ouest: Apport des méthodes d'analyses de données multi-tableaux. D. Jouffre, Thiam, S. Traoré, A. Caverivière, F. Domain, C. Inejih, G. Domalain. Plan. Problématique Données

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D. Jouffre, Thiam, S. Traoré, A. Caverivière, F. Domain, C. Inejih, G. Domalain.

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  1. La question de la comparaison intra-régionale des communautés de poissons démersaux d'Afrique de l'Ouest: Apport des méthodes d'analyses de données multi-tableaux. D. Jouffre, Thiam, S. Traoré, A. Caverivière, F. Domain, C. Inejih, G. Domalain.

  2. Plan • Problématique • Données • Méthodologie d’analyse • Résultats des pré-analyses nationales • Résultats des analyses régionales • Discussion

  3. Problématique • Comparer les faunes démersales à l’échelle régionale: au plan spatial et au plan temporel (tendances, changement?) • Mettre en évidence les parts de structure (et d’évolution) communes et divergentes entre les pays, et identifier les principales espèces qui jouent un rôle à ce niveau.

  4. Données: • Les données de campagnes de chalutages effectuées durant les dernières décennies dans 3 pays d’Afrique de l’Ouest (Mauritanie, Sénégal, Guinée) • Bases nationales (trawlbases) • Séries de campagnes utilisées: • Mauritanie: de 1982 à 1999 (série ND +Aw1999) • Sénégal: de 1986 à 1995 (série LS + Ya1999) • Guinée: de 1985 à 1995 (AN8502 à AN9502)

  5. Méthodologie d’analyse • Un enchaînement de séquences: • => Sélection des espèces par pays • => Pré-analyses nationales (analyses de données mono-tableau) • => Sélection des espèces pour études régionales • => Analyses régionales ou inter-pays:

  6. Méthodologie d’analyse (suite) • => Analyses régionales ou inter-pays: • par les méthodes factorielles multi-tableaux (analyses de co-inertie, STATIS (l’Hermier des Plantes1976), et doc. ADE4) qui permettent de coordonner les analyses multispécifiques nationales • Programmathèque ADE4 (http://pbil.univ-lyon.fr/ADE-4.html)

  7. RésultatsPré-analyses nationales • Identification des espèces les plus fréquentes: • => calcul des taux d’occurrences et rangement selon les plus forts taux. • => résultats tableaux de rang d’occurrences: • Analyse en soit: 1er niveau de comparaison régionale • Critère d’extraction des données: pour construction des tableaux multi-spécifiques espèces-relevés (tableaux à analyser) • PM => problème rencontré: tenir compte de la qualité de l’information concernant le niveau de précision de détermination (et sa constance) dans les bases de données

  8. RésultatsPré-analyses nationales - Mauritanie Tableau 1 Espèces les plus fréquentes en Mauritanie (rangées par niveau de fréquence décroissant)

  9. RésultatsPré-analyses nationales - Sénégal Tableau 2 Espèces les plus fréquentes Au Sénégal (rangées par niveau de fréquence décroissant)

  10. RésultatsPré-analyses nationales - Guinée Tableau 3 Espèces les plus fréquentes En Guinée (rangées par niveau de fréquence décroissant) Octopus vulgaris 0.2%

  11. RésultatsPré-analyses nationales – MauritanieEvolution temporelle globale 1998 1986 Figure 1 Mauritanie AFC globale Plan 1-2 Individus-campagnes Sur sélection 28 campagnes « homogènes » (au sens détermination taxon.) 1999 Figure 2 Plan 1-2 Variables-taxons (les 50 + fréquents) 1988 Evolution temporelle peu cohérente

  12. RésultatsPré-analyses nationales – MauritanieEvolution temporelle (suite) Figure 3 Mauritanie AFC 3camp. Plan 1-2 Individus-strates Sur sélection 3 campagnes SF bien espacées dans le temps 1990-1995-1999 90 99 95

  13. RésultatsPré-analyses nationales – Mauritaniestructuration spatiale - latitude Figure 4 Mauritanie AFC 3camp. Plan 1-2 Individus-strates Sur sélection 3 campagnes SF bien espacées dans le temps 1990-1995-1999 N C S N: Nord C: Centre S: Sud

  14. RésultatsPré-analyses nationales – Mauritaniestructuration spatiale - profondeur Figure 5 Mauritanie AFC 3camp. Plan 1-2 Individus-strates Sur sélection 3 campagnes Bien espacées dans le temps 1990-1995-1999 3 4 2 5 1 1: 0 à 15m 2: ]15m, 30m] 3: ]30m, 50m] 4: ]50m, 80m] 5: ]80m, et plus]

  15. RésultatsPré-analyses nationales – Mauritaniestructuration => correspondance faune Figure 6 Mauritanie AFC 3camp. Plan 1-2 variables-espèces Sur sélection 3 campagnes Bien espacées dans le temps 1990-1995-1999 Octopus vulgaris Brachydeuterus auritus Scorpaena normani Gradient essentiellement spatial: prof >latitude

  16. RésultatsPré-analyses nationales – SénégalEvolution temporelle globale Figure 7 PCA globale Plan 1-2 des Individus-stations Représentés en zoom A: les centres de gravité des années  Sur série 14 campagnes LA+LS 1970-1995 1995 1990 1970 1988 1991 1993 1994 1989 1986 1992 1987 A Cette analyse porte sur: 20 taxons x 1039 stations Variables-taxons : les 20 + fréquents sur la période) Evolution temporelle peu cohérente

  17. RésultatsPré-analyses nationales – GuinéeEvolution temporelle globale Figure 8 Guinée AFC globale Plan 1-2 Individus-stations (représentés) Sur sélection de campagnes de 1985 à 1990 1988 1991 1992 1985 1986 1987 1989 1990 Figure 9 Plan 1-2 Variables-taxons (les 50 + fréquents) Evolution temporelle légèrement plus conforme à la chronologie. Mais temporel reste peu structurant.

  18. RésultatsPré-analyses nationales Mauritanie –Sénégal – Guinée Mêmes conclusions pour les trois pays • Evolutions temporelles peu cohérentes, • SPATIAL >> TEMPOREL

  19. Résultats Analyses inter-nationales • Mauritanie-Sénégal / Sénégal-Guinée: bi-pays • Mauritanie-Sénégal-Guinée: tri-pays • Identification des espèces fréquentes (communes) • Analyse de la structure sur ces d’espèces (co-structure).

  20. Résultats Analyses inter-nationales Mauritanie-Sénégal Au seuil 10% (i.e. espèces présentes dans au moins 10% des relevés de chaque pays) 24 espèces retenues Tableau 4

  21. Résultats Analyses inter-nationales Sénégal-Guinée Au seuil 10% (i.e. espèces présentes dans au moins 10% des relevés de chaque pays) 17 espèces retenues Tableau 5

  22. Résultats Analyses inter-nationales Mauritanie-Sénégal-Guinée Au seuil 5% (i.e. espèces présentes dans au moins 5% des relevés de chaque pays) 9 espèces retenues Soulignées les espèces retenues au seuil au seuil 10% : 4 espèces Tableau 5

  23. Résultats Analyses inter-nationales Mauritanie Sénégal 24 espèces 24 espèces 52 stations 64 stations 5 1 1985 M84 S86 Analyses bi-pays Mauritanie-Sénégal 93 stations 71 stations 6 2 M90 S90 1990 65 stations 91 stations M95 S95 7 1995 3 Au total: 532 stations 96 stations 2000 M99 4 Espèces communes Stations différentes Figure 10. Schéma général de l’analyse 7 tableaux (campagnes) appariés par les colonnes (espèces)

  24. Résultats Analyses inter-nationales M90 M95 M84 Analyses bi-pays Mauritanie-Sénégal Figure 11 Analyses séparées. (AFC ) Plan 1-2. Projection des individus-coups de chaluts S90 S86 M99 S95

  25. Résultats Analyses inter-nationales M90 M95 M84 Analyses bi-pays Mauritanie-Sénégal Figure 12 Analyses séparées. (AFC) Plan 1-2. Projection des variables-espèces S90 S86 M99 S95

  26. Résultats Analyses inter-nationales Analyses bi-pays Mauritanie-Sénégal récent M99 M95 Mauritanie M90 ancien M84 ancien S86 S90 Sénégal S95 récent Figure 13STATIS Projection des coefficients RV dans le plan 1-2 du compromis

  27. Résultats Analyses inter-nationales M90 M84 M95 Analyses bi-pays Mauritanie-Sénégal S90 M99 S86 S95 Figure 14STATIS (Analyses coordonnées) Plan 1-2. Projection des individus-coups de chaluts

  28. Résultats Analyses inter-nationales Analyses bi-pays Mauritanie-Sénégal Figure 15STATIS Plan 1-2. Compromis des espèces ubiquistes côtières de fonds intermédiaires

  29. Résultats Analyses inter-nationales S86 Variables Figure 16 STATIS Plan 1-2. Compromis des espèces et leurs trajectoires M84 Analyses bi-pays Mauritanie-Sénégal Trichiurus lepturus Zeus faber Penaeus notialis Brachydeuterus auritus Mustelus mustelus Trachurus trecae Raja miraletus Argyrosomus regius Octopus vulgaris Galeoides decadactylus Boops boops Chelidonichthys gabonensis Dentex canariensis Epinephelus aeneus Pagellus bellottii Pomadasys incisus Pseudupeneus prayensis Sepia officinalis Solea senegalensis Sparus caeruleostictus Syacium micrurum Bothus podas Groupe A Zanobatus schoenleinii Groupe A Stables Decapterus rhonchus S90

  30. Discussion • Structures temporelles observées: Peu de tendances cohérentes (que ce soit à l’échelle nationale ou régionale) • Les raisons: • De fond: Facteur spatial plus structurant que le temporel • Méthodo: « Par définition » les méthodes multi-spécifiques comparent les échantillons sur la base de leur composition ou profil spécifique. Or ce critère est très sensible aux variations de « qualité » des déterminations => des variations à ce niveau peuvent brouiller les tendances « temporelles », surtout lorsqu’elles sont par ailleurs faiblement structurées.

  31. Discussion • Néanmoins: • On distingue des espèces qui présentent une répartition spatio-temporelle cohérente à l’échelle régionale (i.e. similaire dans les différent pays) et d’autres qui présentent des patterns d’évolution locaux. • Au niveau macroscopique: • A l’échelle des deux pays Mauritanie-Sénégal: une certaine divergence (des structures fauniques respectives sur les 22 espèces) au cours du temps=> effets de la pêche? • A l’échelle des trois pays, Mauritanie-Sénégal-Guinée: un effet année fort induisant une convergence des structures (sur les 9 espèces communes « principales ») -> effet hydro-climatique?

  32. Discussion • Perspectives: • Ce type d’analyses coordonnées mais par pays (inter-dates), sur strates spatio-temporelles (Analyse triadique partielles). • Autres points de vues de prises en compte des données : par classes de niveaux trophiques , par niveau taxon supérieur (familles).

  33. Je vous remercie

  34. Annexe: détail analyse co-inertie tri-pays

  35. Résultats Analyses inter-nationales Guinée Mauritanie Sénégal 9 espèces 9 espèces 9 espèces 47 stations 65 stations 64 stations 1985 1 M84 S86 S86 8 5 Analyses Tri-pays Mauritanie-Sénégal-Guinée 75 stations 25 stations 67 stations 9 2 6 M90 S90 S90 1990 72 stations 78 stations 64 stations M95 S95 S95 1995 7 10 3 Au total: 608 stations 51 stations 2000 4 Espèces communes Stations différentes M99 Figure 17. Schéma général de l’analyse 10 tableaux (campagnes) appariés par les colonnes (espèces)

  36. Résultats Analyses inter-nationales Analyses tri-pays Mauritanie-Sénégal-Guinée G85 85 M99 S86 M84 M95 95 S95 G95 S90 M90 90 G90 Figure 18STATIS Projection des coefficients RV

  37. Résultats Analyses inter-nationales Analyses tri-pays Mauritanie-Sénégal-Guinée Figure 19STATIS Plan 1-2. Compromis des espèces et leur trajectoire Dentex canariensis Plus profonds, Fonds durs Sepia officinalis Epinephelus aeneus Alectis alexandrinus Trichiurus lepturus Semi- pélagiques Pomadasys jubelini Selene dorsalis Côtières Brachydeuterus auritus Galeoides decadactylus

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