1 / 17

Немного о ядерном магнитном резонансе

Немного о ядерном магнитном резонансе. С.А.Спирин 27 октября 20 10. Статистика PDB. As of Tuesday Oct 26, 2010. Энергия протона в магнитном поле.

drago
Download Presentation

Немного о ядерном магнитном резонансе

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Немного о ядерном магнитном резонансе С.А.Спирин27 октября 2010

  2. Статистика PDB As of Tuesday Oct 26, 2010

  3. Энергия протона в магнитном поле При любом направлении магнитного поля протон будет иметь ровно две возможных энергии (соответствующие направлениям его «оси вращения» точно по полю или точно против поля). Разница между энергиями линейно растёт с ростом величины поля. NB: реально у протона нет никакой «оси», это не более чем метафора!

  4. Кванты электромагнитной волны и ядерный магнитный резонанс Электромагнитные волны испускаются и поглощаются только порциями (квантами), энергия которых связана с частотой волны соотношением: E=h , где h = 6,626 Джсек – постоянная Планка. Если поместить образец, содержащий протоны, в неоднородное магнитное поле, то по поглощению волн данной частоты можно судить о количестве протонов, имеющих данную разницу уровней энергии, то есть находящихся в поле данной силы (а значит, в заданной области пространства). Волны определённой частоты как бы «резонируют» с протонами в поле определённой силы. На этом явлении основана ЯМР-томография, применяемая в медицине. В ЯМР-спектроскопии биомолекул поступают наоборот: измеряют энергию, испускаемую протонами при переходе с верхнего уровня на нижний, по частотам испускаемого ими излучения (после возбуждения мощным электромагнитным импульсом).

  5. Химический сдвиг δ = (ν– νREF) x106 / νREF

  6. Химические сдвиги

  7. Химические сдвиги для протона Кроме химического окружения,  зависит также от температуры, pH, концентрации, растворителя…

  8. ЯМР-спектрометр

  9. ЯМР-спектрометр – загрузка образца Исследуемый образец

  10. ЯМР-спектр

  11. ЯМР-спектр протонов для диэтилового эфира

  12. Измерение торсионного угла φ (1) Right-handed alpha helix, φ = –57°, 3JHNHA= 3.9 Hz (2) Right handed 3.10 helix, φ = –60°, 3JHNHA= 4.2 Hz (3) Antiparallel beta sheet, φ = –139°, 3JHNHA= 8.9 Hz (4) Parallel beta sheet, φ = –119°, 3JHNHA= 9.7 Hz (5) Left-handed alpha helix, φ = 57°, 3JHNHA= 6.9 Hz

  13. Двумерный ЯМР • Измеряются небольшие расстояния (< 6 Å) междуядрами водорода, углерода, азота и фосфора • Из этого набора данных восстанавливается укладка белка

  14. Результат: множество моделей 1NK2 (20 моделей)

  15. Усреднённая модель 1NK2 1NK3

  16. Сравнительная таблица

More Related