Wsp czynnik spokrewnienia addytywnego
This presentation is the property of its rightful owner.
Sponsored Links
1 / 17

Współczynnik spokrewnienia addytywnego PowerPoint PPT Presentation


  • 77 Views
  • Uploaded on
  • Presentation posted in: General

Współczynnik spokrewnienia addytywnego. Metoda tabelaryczna. Współczynnik spokrewnienia addytywnego.

Download Presentation

Współczynnik spokrewnienia addytywnego

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Presentation Transcript


Wsp czynnik spokrewnienia addytywnego

Współczynnik spokrewnienia addytywnego

Metoda tabelaryczna


Wsp czynnik spokrewnienia addytywnego1

Współczynnik spokrewnienia addytywnego

  • Kopie takich samych genów, które dwa osobniki odziedziczyły po wspólnym przodku, nazywamy genami identycznymi dzięki pochodzeniu, zaś podwojona frakcja tych genów stanowi współczynnik spokrewnienia addytywnego (aij).

  • W metodzie tej współczynniki spokrewnienia tworzą uporządkowaną tablicę liczb zwaną macierzą spokrewnień.


Tworzenie macierzy spokrewnie

Tworzenie macierzy spokrewnień

  • Rodowód tabelaryczny

  • Utworzenie listy wszystkich zwierząt w porządku chronologicznym

Najstarsze

Najmłodsze


1a tworzenie macierzy spokrewnie

1A. Tworzenie macierzy spokrewnień

  • Każdemu osobnikowi, który nie posiada informacji o obojgu rodziców

  • wpisujemy jedynki na przekątnej diagonalnej.

  • Nad przekątną wpisujemy zera zakładając, że osobniki te nie są ze sobą spokrewnione. Przyjmuje się wtedy, że spokrewnienie pomiędzy osobnikiem a nim samym wynosi 1.


1b tworzenie macierzy spokrewnie

1B. Tworzenie macierzy spokrewnień

  • Każdemu osobnikowi, który nie posiada informacji o obojgu rodziców

  • wpisujemy jedynki na przekątnej diagonalnej.

  • Nad przekątną wpisujemy zera zakładając, że osobniki te nie są ze sobą spokrewnione. Przyjmuje się wtedy, że spokrewnienie pomiędzy osobnikiem a nim samym wynosi 1.


2a tworzenie macierzy spokrewnie

2A.Tworzenie macierzy spokrewnień

  • Osobnik i spokrewniony jest z osobnikiem j w wysokości równej średniej ze spokrewnień między nim (i) a rodzicami drugiego osobnika (j, rodzice p i q).

  • ii j – osobniki dla których liczymy wsp. spokrewnienia (i – starszy, wcześniej w tabeli; j – młodszy, dalej w tabeli)

  • p i q – rodzice osobnika j

  • aij=0,5(aip+ aiq)


2a tworzenie macierzy spokrewnie1

2A.Tworzenie macierzy spokrewnień

  • Spokrewnienie osobnika D z osobnikiem A

  • Rodzicami osobnika młodszego D są osobniki A i B, więc:

  • aDA=0,5(aAA+ aAB)=0,5(1+0)=0,5


2a tworzenie macierzy spokrewnie2

2A.Tworzenie macierzy spokrewnień

  • Spokrewnienie osobnika E z osobnikiem A

  • Rodzicami osobnika młodszego E są osobniki A i C, więc:

  • aEA=0,5(aAA+ aAC)=0,5(1+0)=0,5


2a tworzenie macierzy spokrewnie3

2A.Tworzenie macierzy spokrewnień

  • Spokrewnienie osobnika E z osobnikiem B

  • Rodzicami osobnika młodszego E są osobniki A i C, więc:

  • aEB=0,5(aBA+ aBC)=0,5(0+0)=0


2a tworzenie macierzy spokrewnie4

2A.Tworzenie macierzy spokrewnień

  • Spokrewnienie osobnika F z osobnikiem B

  • Rodzicami osobnika młodszego F są osobniki E i D, więc:

  • aFB=0,5(aBE+ aBD)=0,5(0+0,5)=0,25


3a tworzenie macierzy spokrewnie

3A.Tworzenie macierzy spokrewnień

  • Obliczamy element diagonalny dla osobnika D . Jest równy jedności plus

  • wartość współczynnika inbredu dla tego zwierzęcia (połowa spokrewnienia

  • pomiędzy rodzicami)

  • i – osobnik dla którego liczymy wsp. spokrewnienia

  • p i q – rodzice osobnika i

  • aii=1 + 0,5apq


3a tworzenie macierzy spokrewnie1

3A.Tworzenie macierzy spokrewnień

  • Obliczamy element diagonalny dla osobnika D .

  • aDD=1 + 0,5aAB=1+0 *0=1


4 tworzenie macierzy spokrewnie

4.Tworzenie macierzy spokrewnień

  • Ponieważ macierz jest symetryczna uzupełniamy elementy poniżej przekątnej

  • Obliczamy element diagonalny dla osobnika F .

  • aFF=1 + 0,5ED=1+0,5 * 0,25=1,125


5a wsp czynnik spokrewnienia w uj ciu klasycznym

5A.Współczynnik spokrewnienia w ujęciu klasycznym

Aby z tak skonstruowanej macierzy spokrewnień obliczyć wsp. spokrewnienia

w ujęciu klasycznym, należy podzielić spokrewnienie pomiędzy osobnikamiaij

poprzez elementy leżące na przekątnej dla tych osobników aii i ajj


5a wsp czynnik spokrewnienia w uj ciu klasycznym1

5A.Współczynnik spokrewnienia w ujęciu klasycznym

Obliczamy współczynnik spokrewnienia w ujęciu klasycznym dla osobników E i F


Zadanie 1

Zadanie 1.


Wsp czynnik spokrewnienia addytywnego

Zadanie 2.


  • Login