BOLILLA 1: ENZIMAS. Introducción: Nomenclatura y clasificación.

1. BOLILLA 1: ENZIMAS. Introducción: Nomenclatura y clasificación. Determinación de la actividad enzimática. Unidades. Complejo enzima-sustrato. Sitio activo. Cinética enzimática. Factores que modifican la actividad enzimática. Tipos de Inhibiciones. Regulación. Enzimas alostéricas. Propiedades y cinética. Control por proteínas: activación proteolítica. Modulación covalente. Isoenzimas. Regulación de la expresión génica: represión e inducción enzimática.

2. ECUACIÓN DE LINEWEAVER-BURK Ordenada al origen = 1/Vmáx. Intersección c/eje x = - 1/Km El valor de km guarda relación inversa con la afinidad de la E por el S A MAYOR AFINIDAD, MENOR VALOR DE Km

3. Los valores de Km y Vmax de una enzima se determinan experimentalmente  • Midiendo las velocidades iniciales de reacción a diferentes [S]. • Esta representación de dobles recíprocas tiene la ventaja de permitir una determinación mas precisa de Vmax, valor que solo puede obtenerse a partir de la fórmula de Vo frente a [S].

4. [S] >>>>> [E] Kd La k2 es la velocidad de descomposición del [ES], es una reacción lenta y limita la velocidad de reacción global la velocidad de la reacción completa será proporcional a la [ES]

5. Número de recambio Incorpora las K de velocidad de todas las reacciones entre [ES] y los P

6. Kcat /Km

7. Cuando la [S] es muy baja, la relación kcat/Km se comporta como una K de velocidad de segundo orden. • Esta K tiene un valor máximo dado por la frecuencia con la que pueden colisionar las moléculas de E y S. • Es la velocidad de difusión del S en el sitio activo de la E. • En los seres vivos, para aquellas enzimas que no alcanzan este grado de eficacia, el proceso se optimiza con la organización de la enzimas en los complejos multienzimáticos.

8. INHIBIDORES ENZIMÁTICOS • Agentes químicos que inhiben la acción catalítica de enzimas. • Algunos ejercen su acción uniéndose a sitios o grupos funcionales esenciales de la E. • Estas sustancias son de gran utilidad para estudiar algunos aspectos de la acción enzimática. • Por ejemplo, que grupos funcionales son los que participan en la catálisis o son responsables de asegurar los requerimientos estructurales para la unión E-S. • La inhibición puede ser reversible o irreversible.

9. INHIBICIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA • INHIBIDORES IRREVERSIBLES • Sustancias que producen un cambio permanente en la molécula deenzima. • Producen un deterioro de su capacidad catalítica. • Ej. Insecticidas, «inhibidores suicidas» (semejantes estructuralmente al S y ocupan el sitio activo, caso del allopurinol- xantina oxidasa como tratamiento de la Gota)

10. INHIBIDORES REVERSIBLES • Sustancias que producen un cambiode la capacidad catalítica de la enzima pero su acción no es permanente, el complejo [EI] se disocia rápidamente. • La inhibición reversible puede ser: • COMPETITIVA • NO COMPETITIVA • ACOMPETITIVA

11. El efecto de inhibición competitiva se logra por diferentes mecanismos: • I con estructura similar al S, ambos compiten por el sitio activo de la E. • I que se unen al sitio activo aunque no tengan similitud estructural con el S. • I y S se unen a diferentes sitios de la E, pero la unión de uno impide la del otro, porque induce cambios conformacionales en la E. • La inhibición de tipo competitivo se revierte aumentando la [S]. • De ese modo tiende a desplazar al I de su unión con la enzima.

12. INHIBIDORES REVERSIBLES COMPETITIVOS

13. Semejanza estructural

14. INHIBIDORES REVERSIBLES NO COMPETITIVOS • La unión S-E no esta afectada, porque el I se une a la E libre o al [ES]. • Una vez formado el [ESI] la enzima se inactiva. • El valor de Km no se modifica, pues el S reacciona con la E igual que en ausencia del I. • Ejemplos: reactivos que se unen a grupos –SH de cisteína, indispensables para algunas enzimas, iones metálicos (Cu2+, Hg2+ y Ag2+). • Otros I se unen a los metales componentes de la E, por ejemplo: cianuro se une fuertemente al Fe de los citocromos, catalasas y así bloquean su actividad.

15. INHIBIDORES REVERSIBLES NO COMPETITIVOS Se unen a la E en un sitio diferente al sitio activo Este tipo de inhibición no es revertida por aumento de la [S]

16. INHIBIDORES ACOMPETITIVOS • Son inhibidores reversibles. • El I se une al complejo ES  ESI • Hay 2 reacciones que producen: • 1- ESI • 2- P • Este tipo de inhibición se da en casos en los cuales participan varios sustratos en la reacción. • No es revertida por aumento de la [S].

20. REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA • La AE en las células se ajusta a las necesidades fisiológicas, cambiantes permanentemente. • A [S] bajas, la AE es proporcional a los niveles de S. • En condiciones fisiológicas, la [S] se encuentra por debajo o próxima al Km, así los niveles de S, determinarán la mayor o menor AE. • A mayor [S]  mayor AE • La E que cataliza la primera etapa de una vía metabólica suele ser reguladora.

21. Los seres vivos han generado mecanismos para regular las rutas bioquímicas. • La regulación es esencial por las siguientes razones: • Mantenimiento de un estado ordenado  no hay desperdicio de recursos. • Conservación de la energía  utilización de la En suficiente en las células, para consumir los nutrientes según sus necesidades energéticas. • Respuesta a variaciones ambientales son los ajustes rápidos que deben realizar las células (pH, [S], T°C), por su capacidad de aumentar o disminuir la velocidad de las reacciones específicas.

22. Enzimas Constitutivas Compartimentalización

23. ENZIMAS ALOSTÉRICAS Regulación por retroinhibición o Feed- back negativo • Tanto la inhibición como la activación son reversibles. • El agente modificador actúa uniéndose a la E en un sitio diferente al sitio catalítico Estas Enzimas Alostéricas, además del sitio catalítico, presentan otros sitios reguladores donde se unirán moléculas que actúan sobre su AE. • Moduladores, modificadores o efectores alostéricos • Positivos o negativos para la AE. • Efector Homotrópico: el propio sustrato actúa como efector positivo. • Efector Heterotrópico: efector diferente del sustrato.

24. Los moduladores alostéricos (-) no deben ser confundidos con los Inhibidores. • Sus efectos cinéticos son diferentes. • No miden cambios conformacionales entre formas activas e inactivas de la enzima. Forma T Modifican la conformación de la E Forma R

25. REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA ENZIMAS ALOSTÉRICAS Modificación enzimática inmediata Curvas sigmoideas: las enzimas con este tipo de cinética pueden regular la [S]

28. ATP ADP QUINASA DE PROTEÍNAS ENZIMA ENZIMA OH OPO3= FOSFATASA DE PROTEÍNAS H2O HPO4= REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA MODIFICACIÓN COVALENTE (modificación enzimática mediata o minutos) Adición o remoción de grupos fosfato sobre residuos de Serina, Treonina o Tirosina específicos de la enzima. Quinasas de proteínasfamilia de enzimas que catalizan reacciones de fosforilación utilizan como dador del grupo fosfato al ATP. Fosfatasas de proteínasseparan los grupos fosfatos de las enzimas fosforiladas

29. Otros grupos: adenilo, uridilo, metilo

30. Glucógeno fosforilasa

33. REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA INDUCCIÓN Y REPRESIÓN DE LA SÍNTESIS ENZIMÁTICA  A NIVEL GÉNICO (modificación enzimática en horas o días) INDUCCIÓN  síntesis enzimática aumentada REPRESIÓN  síntesis enzimática disminuida CONSECUENCIA  cambios en la población total de sitios activos. Una enzima puede responder a más de un tipo de regulación

37. Hígado: no inhibida por G-6-P Músculo: inhibida por G-6-P