Audition concours CR2-2011-1 : Mécanismes moléculaires et biodiversité métabolique

1. Audition concours CR2-2011-1 :Mécanismes moléculaires et biodiversité métabolique Violaine Olivier • Caractérisation des mortalités d’abeilles • Mécanismes moléculaires de la plasticité phénotypique Mardi 31 mai 2011

2. Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Deux profils différents mais des compétences similaires Insectes Biologie moléculaire Transcriptomique Bioinformatique Communication

3. Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Curriculum vitae Cursus universitaire 2003 - Maitrise de biologie cellulaire et physiologie 2004 - DEA Bioinformatique, Biologie Structurale et Génomique 2008 - Doctorat BBSG Expériences professionnelles 2004 – Stagiaire de DEA, TAGC, INSERM EMR 206 Marseille, Rémi Houlgatte 2005-2008 – Doctorant, Pathologie de l’abeille, AFSSA Sophia-Antipolis, Magali Ribière 2008-2010 – Post-doctorant, PISC, INRA Versailles, Emmanuelle Jacquin-Joly

4. Gène X Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 DEA : "Mise en place de la technologie du ChIP-Chip pour l’étude des réseaux de régulation des gènes impliqués dans le cancer du sein, recherche des gènes cibles du facteur de transcription GATA3" GATA3 Puce à ADN ChIP + Chip Immuno-précipitation de GATA3 Puce à ADN enrichie en séquences promotrices Fragments d’ADN : séquences promotrices Mise en évidence des gènes régulés par le facteur de transcription GATA3

5. Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 DEA : "Mise en place de la technologie du ChIP-Chip pour l’étude des réseaux de régulation des gènes impliqués dans le cancer du sein, recherche des gènes cibles du facteur de transcription GATA3"

6. Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 DEA : "Mise en place de la technologie du ChIP-Chip pour l’étude des réseaux de régulation des gènes impliqués dans le cancer du sein, recherche des gènes cibles du facteur de transcription GATA3" • Biologie moléculaire • PCR • Immuno-précipitation de la chromatine • Puce à ADN Bioinformatique • Analyse de séquences • Programmation Formation Bioinformatique Linux ; Programmation R ; Analyse des données transcriptomiques (Unité MIG, INRA Jouy-en-Josas)

7. Imidaclopride Fipronil Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Thèse : "Caractérisation du virus de la paralysie chronique (CBPV) et étude de l’infection chez son hôte l’abeille Apis mellifera"

8. Production du virus PM 9 kb Purification du virus 6 kb 5 kb 4 kb 3 kb 2.5 kb Analyse des ARN 2 kb 1.5 kb Nodavirus 20 nm 1 kb Séquençage et analyse SmV A Tombusvirus ARN 1 0.5 kb 3’ 5’ Analyse phylogénétique ARN 2 3’ 5’ Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Thèse : Caractérisation du CBPV

9. Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Thèse : Caractérisation du CBPV

10. Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Thèse : Caractérisation du CBPV Pathologie de l’abeille • Infections expérimentales • Purification virale • Analyses des comportements • Observation des symptômes • Diagnostics différentiels • Détection moléculaire des principaux virus Microscopieélectronique Biologie moléculaire • Électrophorèse ARN et ADN, Southern blot • Banque d’ADNc, Clonage moléculaire • RACE PCR, Transcription inverse Bioinformatique • Analyse de séquences • Phylogénie Olivier, V., et al. (2008). Molecular characterisation and phylogenetic analysis of Chronic bee paralysis virus, a honey bee virus. Virus Res. 132, 59-68.

11. Thèse : Détection moléculaire du virus Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Connaissance de la séquence génomique virale Étude de la variabilité => amélioration de la sensibilité du test PCR (diagnostic) Mise en place de techniques de détection moléculaire Blanchard, P., Olivier, V., et al. (2008). Improvement of RT-PCR detection of chronic bee paralysis virus (CBPV) required by the description of genomic variability in French CBPV isolates. J.Invertebr.Pathol. 97, 182-185. Blanchard, P., Schurr, F., Olivier, V., et al. (2009). Phylogenetic analysis of the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and a predicted structural protein (pSP) of the Chronic bee paralysis virus (CBPV) isolated from various geographic regions. Virus Res. 144, 334-338. PCR en temps réel Hybridation in situ PCR sur le brin négatif

12. Glandes hypopharyngiennes Hémolymphe Tube digestif Cerveau Lobes optiques Corps pédonculés et corps central Lobes antennaires Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Thèse : Étude de l’infection chez A. mellifera 1. Le virus dans l’abeille • Relation avec les symptômes observés • Voies potentielles de dissémination 2. Le virus dans la ruche et son environnement ? ? • Voies potentielles de dissémination • Réservoirs potentiels Camponotus vagus Varroa destructor CBPV + Réplication CBPV + Réplication ? ? CBPV + Réplication Formica rufa fecès CBPV + Infectieux CBPV + Ruche Environnement

13. Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Thèse : Étude de l’infection chez A. mellifera

14. Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Thèse : Étude de l’infection chez A. mellifera Abeille • Physiologie • Anatomie • Histologie • Comportement Interactions abeilles/environnement • Abeille/Abeille • Pathogènes (virus ; acarien) • Extérieur (arthropodes) Biologie moléculaire • Hybridation in situ • PCR temps réel Formations (Université C. Bernard, Lyon ) Olivier, V. et al. (2008). In situ hybridization assays for localization of the chronic bee paralysis virus in the honey bee (Apis mellifera) brain. J.Virol.Methods 153, 232-237. Blanchard, P., Ribiere, M., Celle, O., Lallemand, P., Schurr, F., Olivier, V. et al. (2007). Evaluation of a real-time two-step RT-PCR assay for quantitation of Chronic bee paralysis virus (CBPV) genome in experimentally-infected bee tissues and in life stages of a symptomatic colony. J.Virol.Methods 141, 7-13. Celle, O., Blanchard, P., Olivier, V. et al. (2008). Detection of Chronic bee paralysis virus (CBPV) genome and its replicative RNA form in various hosts and possible ways of spread. Virus Res. 133, 280-284. Ribiere, M., Lallemand, P., Iscache, A. L., Schurr, F., Celle, O., Blanchard, P., Olivier, V. et al. (2007). Spread of infectious chronic bee paralysis virus by honeybee (Apis mellifera L.) feces. Appl.Environ.Microbiol. 73, 7711-7716.

15. Post-doctorat : L’olfaction chez les insectes Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Communication sociale Nourriture Communication sexuelle

16. = + Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Post-doctorat : Les récepteurs olfactifs chez Spodoptera littoralis • Caractérisation des récepteurs olfactifs 2. Microgénomique de la sensille phéromonale (Projet ANR LepidOLF) Transcriptome antennes 20 000 EST Récepteurs olfactifs Séquençage haut débit

17. Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Post-doctorat : Les récepteurs olfactifs chez Spodoptera littoralis

18. Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Post-doctorat : Les récepteurs olfactifs chez Spodoptera littoralis Biologie moléculaire • PCR, PCR temps réel, Hybridation in situ • Travail sur de petites quantités Bioinformatique • Phylogénie • Analyses des données de transcriptomique Microdissection Modèle noctuelle Olivier, V. et al. (2010). Candidate chemosensory ionotropic receptors in a Lepidoptera. Insect Mol.Biol.

19. Violaine Olivier – concours CR2-1 – mortalités d’abeilles ; plasticité phénotypique – 31/05/11 Mes formations et autres compétences • Formations adéquates • PCR temps réel • Hybridation in situ • Bioinformatique • Communications écrites : • 8 articles scientifiques (3 en premier auteur) • 2 revues (1 en premier auteur) et 1 éditorial • Communications orales : • 1 congrès national et 4 internationaux • Organisation du congrès "BRAVE " (Bee Research and Virology in Europe) • Collaborations : • Monique Gauthier, CRCA, Toulouse • Jürgen Krieger, Université de Hohenheim, Stuttgart, Allemagne • Claudia Bevilacqua, INRA, Jouy-en-Josas Communications, vulgarisation, travail en équipe, intégration, collaborations, organisation, contacts humains.