1 / 29

DanBIF danbif.dk Danish Biodiversity Information Facility

DanBIF www.danbif.dk Danish Biodiversity Information Facility. Seminar om DanBIF og Amterne – Ny mulighed for samlet adgang til naturdata i Danmark Zoologisk Museum, København 8. november 2004 Isabel Calabuig - DanBIF Projektleder icalabuig@zmuc.ku.dk.

brent-morrison
Download Presentation

DanBIF danbif.dk Danish Biodiversity Information Facility

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. DanBIFwww.danbif.dkDanish Biodiversity Information Facility Seminar om DanBIF og Amterne – Ny mulighed for samlet adgang til naturdata i Danmark Zoologisk Museum, København 8. november 2004 Isabel Calabuig - DanBIF Projektleder icalabuig@zmuc.ku.dk

  2. DanBIFwww.danbif.dkDanish Biodiversity Information Facility Dansk knudepunkt i GBIF netværket per. 1. Juli 2001 Finansiering: Hidtidig kontrakt mellem det Naturvidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet og Statens Naturvidenskabelige Forskningsråd (SNF) Vært: Zoologisk Museum, Københavns Universitet

  3. DanBIF Organisation • Bestyrelse • Sekretariat • Netværk af grund- og sektorforskningsinstitutioner • Kreds af yderligere dataholdere

  4. DanBIF Mål & Aktiviteter inkluderer bl.a.: • Opfylde GBIF medlemskrav, f.eks. • Deltage aktivt i GBIF bestyrelse og komité for netværket af knudepunkter • Opbygge, køre og vedligeholde et IT system og et sekretariat for at opfylde kravene & anbefalinger (samarbejde i relevante internationale (EU) projekter) • Gøre danske biologiske datasæt og oplysninger om dem tilgængelige for søgning via GBIF portal • Opbygge og organisere aktiviteter for et netværk af danske forskningsinstitutioner og andre dataleverandører • Skabe forum for mulig skabelse af nye tværgående forskningssamarbejder • Blive Dansk videncenter og Internet gateway til information om biodiversitet

  5. DanBIF Aktiviteter • Databaseret katalog for oversigt over naturhistoriske samlinger og andre typer af samlinger / datasæt fra forskning, forvaltning, industri, amatørbiologer etc. • hvad enten de findes på digital form eller ej • Online spørgeskema om naturhistoriske samlinger - Collections Metadata Inventory – som også publiceres og gøres søgbart • IT-Rådgivning/formidling: • digitalisering af naturhistoriske samlinger og andre naturdata • database design og web-implementering • Identifikation og klargøring af biologiske databaser for søgning (eller link) via DanBIF/GBIF portalerne • Dansk Web-portal med samlet adgang til al informationen - http://www.danbif.dk

  6. http://www.danbif.dk

  7. Hvorfor har DanBIF indbudt Amterne til Seminar? • Naturovervågningsdata fra amter, DMU m.fl. relevant i DanBIF-sammenhæng: • Større brugerflade - inkl. amter, kommuner, interesseorganisationer (& lodsejere, m.fl.)  • Amterne lettere adgang til hinandens data og mange andre datakilder!  • Lettere indrapportering af data til DMU  • Lettere indrapportering fra DMU til Skov- og Naturstyrelsen  • Lettere indrapportering fra S&N til EU • BEDRE BREDT FUNDERET VIDENSBASIS FOR VIDTGÅENDE BESLUTNINGER OM BESKYTTELSE AF TRUEDE ARTER • Bevarelse af, og bred adgang til, data, viden og kompetencer • Link til andre datatyper, e.g. miljø, klima, habitatdata

  8. GBIF henter følgende data via DanBIF • Primary biodiversity data: • Eksemplarer • Observationer • Navne • Arter • Litteratur • Metadata om ovenstående

  9. GBIF søgeportal PROTOTYPE -http//www.gbif.net • DATAGRUNDLAG, BRUGERFLADE, FUNKTIONALITET øges & udbygges, inkluderer for nuværende bl.a.: • Data om Danmark fra globale leverandører • Data fra Danmark om arter globalt • Artslister for et land – Globalt ECAT – Synonymer • Udbredelse • HVEM har oplysningerne/eksemplarerne? • Senere kommer: • Species Bank • Link til andre datatyper – økologi, abiotiske faktorer, genetik, litteratur, etc. etc.

  10. GBIF PortalenFørste eksempel på Rødlistearter fra Botanisk Musem, KU tilwww.gbif.net Pilledrager, Pilularia globulifera. Foto: B. Øllgaard.

  11. Bemærk landevalg og andre valgmuligheder

  12. Søgeresultat fra MANGE leverandører!

  13. Stationære versus Dynamiske Kort!

  14. PROTOTYPEmen unik ny mulighed, så HUSK: • Vi trækker data fra hele verden! • Vi trækker fra mange forskellige data formater! • Forskelle i skalering! • Kortgrundlag er for nuværende meget basalt • samme format for hele verden = laveste fællesnævner, men senere direkte link

  15. Dataudveksling inden for GBIF IT-Arkitekturen Metadata and name query Provider query Index Portal UDDI Registry Request Manager Metadata Cache Institutions Services (Providers) AccessPoints Available providers Query Engine Metadata response Accounting Publish availability Metadata and logs Data query Data response Synonyms, GUIDs Name provider Data provider Provider Services Provider Services DiGIR Resource Resource Metadata Resource Metadata Resource Metadata SOAP Metadata HTTP

  16. DanBIF værktøjetHvad kræves for at gøre data søgbare online? • Kobling (mapping) af datasæts felter/kolonner med Darwin Core 2 skema standarden • Minimum: artsnavn men også gerne indsamler, indsamlingsår, -sted osv. (47 felter) • Rensning og evt. Konvertering af data til Darwin Core format (årstal 19?; 199?; formatering af georeference) • Eksport af datasæt til tekstfilformat • Oprettelse af struktur v. angivelse af standard oplysninger OM datasættet på DanBIF provider serveren • Foregår decentralt via Internettet • Inkl. standardoplysninger om dataleverandøren - Hvorfra kommer datasættet? • Uploading af datasættet i tekstfilformat til DanBIF provider serveren under den struktur oprettet i forrige punkt • Frigivelse af datasættet til offentliggørelse, f.eks. global søgning via GBIF portalen DanBIF vil bistå under hele forløbet!

  17. Data Exchange Format: Darwin Core2 • XML skema for data udveksling, e.g. ved forespørgsler fra bruger • Passende for samlinger og observationsdata • 48 koncepter (data elementer): *= required element

  18. Fremtiden • Data vil blive sikkert forvaltet, katalogiseret og vedligeholdt på DanBIF serveren • Udover GBIF, vil data fra DanBIF serveren kunne gøres søgbare på DanBIF portalen og/eller andre, e.g. miljøportalen

  19. Fremtiden • Data bliver beriget ved rensning, intelligent indeksering, og sammenstilling med andre typer data • På sigt vil kunne udvikles software der muliggør udnyttelse af datagrundlaget i mange andre sammenhænge: • så man f.eks. kun arbejder med danske data fra amter, f.eks. via miljøportalen

  20. Eksempler på Internetportaler • Fishbase - http://www.fishbase.org/search.cfm • Freshwater Life - http://www.freshwaterlife.info • EEA - http://local.da.eea.eu.int/ • NBN, UK, GBIF knudepunkt - http://www.nbn.org.uk/ • Artportalen, Sverige - http://artportalen.se/

  21. DanBIF – www.danbif.dk Tak for opmærksomheden SPØRGSMÅL?

More Related