כ"אב טיפוס"
Download
1 / 18

כ"אב טיפוס" Pubmed מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez - PowerPoint PPT Presentation


  • 175 Views
  • Uploaded on

כ"אב טיפוס" Pubmed מאגר ה- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez. Entrez. PubMed הוא חלק ממערכת גדולה לאחזור מידע המבוססת על רשת האינטרנט, שפותחה ע"י המרכז הלאומי למידע ביוטכנולוגי (NCBI) : National Center for Biotechnology Information בספריה הלאומית הרפואית של ארה"ב.

loader
I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.
capcha
Download Presentation

PowerPoint Slideshow about ' כ"אב טיפוס" Pubmed מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez' - bijan


An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Presentation Transcript

כ"אב טיפוס" Pubmed מאגר ה-

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


Entrez

PubMedהוא חלק ממערכת גדולה לאחזור מידע המבוססת על רשת האינטרנט, שפותחה ע"י המרכז הלאומי למידע ביוטכנולוגי (NCBI) :

National Center for Biotechnology Information

בספריה הלאומית הרפואית של ארה"ב.

המערכת כוללת מאגרי מידע בתחומי מדעי החיים: רפואה, מבנה ורצף חלבונים, הגנום האנושי – ביולוגיה, טקסונומיה ועוד.

PubMedהוא מאגר אחד במערכת המאגרים הנרחבת, Entrez, לאחזור מידע בכל תחומי מדעי החיים.

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


דרכי גישה למאגר PubMed

  • הגישה הנוחה והפשוטה היא דרך הקישור מאתר הספריה הרפואית:

    http://library.md.huji.ac.il

    זוהי הדרך המומלצת משום שהיא מבטיחה גישה לעיתונים שהספריה מנוייה עליהם.

  • ניתן להגיע אל המאגר דרך כל מנוע חיפוש כמו גוגל למשל באמצעות הקשת המילה PubMed בתיבת החיפוש ולהגיע ישירות אל המאגר מכל מחשב המחובר לרשת האינטרנט.

  • אם כי כאמור זוהי אופציה טובה לחיפוש בלבד.

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


PubMedהואשירות של הספריה הלאומית הרפואית של ארה"ב (NLM). כולל מעל 15 מליון הגדרות נושאים ביו-רפואיים משנות ה-50. בסיס המקורות הם המאגרים:

  • Medline – מאגר המידע הביבליוגרפי של ה-NLM המכיל כ- 13 מליון הפניות למאמרים משנת 1966, בכתבי עת בתחום מדעי החיים מתוך כ- 5000 עיתונים מארה"ב ומ- 70 מדינות מחוצה לה. חלק ניכר מן ההפניות כולל גישה לטקסט מלא, או גישה לתקצירי מחברים. תחומי הכיסוי הם רפואה, רפואת שיניים, סיעוד, וטרינריה, מערכת הבריאות, והמדע הפרה קליני.

  • OldMedline - מאגר מידע ובו הפניות למאמרים מהשנים 1950 – 1965, הכולל כ- 2 מליון הפניות. כיום אין אפשרות חיפוש לפי Mesh terms, במאגר זה.

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


ניתן לבצע חיפוש חופשי ו/או לפי:

  • נושא

  • שם מחבר/ת

  • שנות פרסום המאמר

    המונחים יאותרו בשדות שונים, על ידי שימוש באופרטורים בוליאנים:

    AND OR NOT (באותיות גדולות – חשוב!!!)

  • LIMITS - ניתן לבקש הגבלה לשדה החיפוש שבו יופיע המונח, למשל באלו כתבי עת, בכותרת או בתקציר, בקישורים או בציטוטים, כך גם ניתן לבחור את שפת המאמר, את קבוצת הגיל ואת המין של נושאי המאמר.

  • HISTORY- ניתן לשמור היסטוריה של חיפוש ולבצע חיפוש בתוצאות שנתקבלו ו/או נשמרו.

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


שלוש דרכים עיקריות לביצוע חיפוש:

  • חיפוש פשוט ב-PubMed, מילים בשפה החופשית, בהסתמך על המיפוי האוטומטי: הזנת מילים ב- Search המנוע מציע "תיקון" בעת הזנת מונח שגוי.

  • חיפוש באמצעות האינדקס: בשדות מוגדרים או בכולם יחד, מחבר, כותרת: חיפוש מתקדם Preview/Index

  • חיפוש באמצעות ה- Mesh: לפי נושאים עם תתי נושאים, עם הזנת מונח שגוי המנוע מציע אפשרויות נוספות לפי abc…

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


מיפוי מונחים אוטומטי

מיפוי מונחים אוטומטי פירושו "בדיקת התאמה" של מונחים "בלתי כשירים" על פי הטבלאות שלהלן.

מונחים "בלתי כשירים" הכוונה למונחים ללא הגדרת שדה חיפוש מראש.

המונחים הנ"ל, אם כן, יעברו "בדיקת התאמה" על פי הסדר הבא:

א. מול הMesh - עץ הנושאים הרפואי עליו נפרט

ב. מול טבלת תרגום מונחים

ג. מול טבלת מונחים של כתבי העת

ד. מול טבלה ואינדקס של מחברים

בתהליך זה PubMed מתעלם ממילות עצר –stop words

(in out of and) ומילות קישור.

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


MeSH

הוא למעשה רשימת נושאים רפואיים מפותחת, בדמות עץ בעל ענפים כאשר כל רמה מתרחבת לרמות נוספות, למעשה זהו תיזאורוס מבוקר של הספריה הרפואית הלאומית של ארה"ב (NLM), המשמש למיפתוח מאמרים עבור ה- MEDLINE.

ניתן להגיע ל MeSH בסרגל החיפוש האופקי בPubMed- או ברשימת הקישורים האנכית. מונחי MeSH מאפשרים אחזור עקבי של מידע עבור נושאים שניתן להגדירם במילים שונות. MeSH מארגן את התארנים במבנה היררכי כך שהדולה ימצא מאמרים באופן מדויק יותר. המבנה של MeSH מספק דרך יעילה עבור הדולה לעלעל בעץ הנושאים כדי למצוא את התארנים המתאימים לו.

למשל: "אקופונקטורה כעיסוק" או "אקופונקטורה כטיפול"

"שעון יד" או "שעון קיר"


Home delivery mesh

השני : Midwifery

שיכיל את הנושאים הבאים:

Midwives

Midwife

Traditional Birth Attendant

Birth Attendant, Traditional

Birth Attendants, Traditional

Traditional Birth Attendants

האחד:Home Childbirth

שיכיל את הנושאים הבאים:

Childbirth, Home

Childbirths, Home

Home Childbirths

Delivery, Home

Deliveries, Home

Home Deliveries

Home Delivery

Childbirths at Home

Childbirth at Home

דוגמא לחיפוש: המונח home delivery ב- Meshנקבל שני נושאים:

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


Http library md huji ac il eresources databases index asp
הפניותלמדריכיםבעבריתhttp://library.md.huji.ac.il/Eresources/databases/index.asp

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


Pubmedהתא האישי שלי ב-

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


דוגמה

This message contains My NCBI what's new results from the National Center for Biotechnology Information (NCBI) at the U.S. National Library of Medicine (NLM).Do not reply directly to this message.

Sender's message: Search: (Hyperthyroidism ("last 5 years" (Female) (English) (middle age))) nutrition ("last 5 years" (Female

Sent on Monday, 2008 Oct 13Search (Hyperthyroidism AND ("last 5 years"[EDat] AND (Female[MeSH Terms]) AND (English[lang]) AND (middle age[MeSH]))) AND nutrition AND ("last 5 years"[EDat] AND (Female[MeSH Terms]) AND (English[lang]) AND (middle age[MeSH]))Click here to view complete results in pubmed. (Results may change over time.)To unsubscribe from these e-mail updates click here.

Entrez pubmed Results

Item 1 of 1

[ ]1:

Camargo RY, Tomimori EK, Neves SC, G S Rubio I, Galrão AL, Knobel M, Medeiros-Neto G.

Related Articles,Compound (MeSH Keyword),Substance (MeSH Keyword),LinkOut

Thyroid and the environment: exposure to excessive nutritional iodine increases the prevalence of thyroid disorders in Sao Paulo, Brazil.Eur J Endocrinol. 2008 Sep;159(3):293-9. Epub 2008 Jun 27. PMID: 18586897 [PubMed - indexed for MEDLINE]

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


חיפוש "ציטוט" בודד ב- PubMed לפי נתונים:

שם מחבר, כותרת וכד'

PubMed Single Citation Matcher

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


דוגמאות:

  • חיפוש פשוט-Search :הזנת מונחים למשל: Acupuncture AND hot flashes

    מתקבלות 37 תוצאות.

    חיפוש של Acupuncture מניב :  12370

    חיפוש של Hot flashes מניב : 1698

    שילוב באמצעות History: מניב גם הוא 37 תוצאות.

  • חיפוש באמצעות האינדקס Preview/Index :

    החיפוש יעשה על ידי הקשת המונחים ובחירת השדות שבהם אנו רוצים לחפש את המונח: בכותרת, בשם המחבר, בשם העיתון או כל שדה אחר מהרשימה הקיימת.

    כל מונח יצורף או ינותק מהמונחים הקודמים בהתאם לבקשה ((AND OR NOT כך שניתן ליצור מחרוזת חיפוש ארוכה ומורכבת כמו בדוגמה הבאה:

    AND risk factor [Title] AND risk factor [Mesh term][Title] anorexia Search

  • חיפוש באמצעות ה- Mesh : כניסה ל נושאים דרך הסרגל משמאל, הקשת מונח תציג את הנושא מהיבטים שונים, בחירה של היבט אחד ולחיצה עליו תציג את תתי הנושאים מהם ניתן לבחור את אלו הרצויים לחיפוש.

    (“Acupuncture Therapy" [MAJR:NoExp] OR "Acupuncture Therapy/nursing" [MAJR:NoExp])

    עם קבלת המחרוזת הרצויה בתיבה אפשר לשלוח את החיפוש למאגר ה- PubMed

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


טקסט מלא

  • כניסה דרך אתר הספריה מאפשרת גישה לטקסט מלא לכל העיתונים שהספריה מנוייה עליהם.

  • בנוסף, PubMedמכיל קישורים למאמרים בטקסט מלא של מול"ים ברשת, וקישורים לאתרים כמו ספריות ומרכזים שמציעים גישה חופשית וישירה למאמרים.

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


דוגמא לקישור/גישה לטקסט מלא מ- Pubmed

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Select+from+History&db=pubmed&query_key=3

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


מונחים לדוגמה

  • כזכור אם אנחנו מזינים מונח שגוי בחיפוש הפשוט נקבל מבחר "אפשרויות"

  • אם נזין ב –Preview/Index נקבל טבלאות

  • אם נזין מונח ב-Mesh נקבל קטגוריות נושאים

  • Diabetic food

  • Crohn Disease (chrohon disease)

  • Fever / fiver

  • Menopause (Menapause)

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים  [email protected] , http://library.md.huji.ac.il


תצוגת התוצאות והקישור לטקסט מלא

  • האפשרותDisplay בצד שמאל מציעה צורות תצוגה שונות, בחירה באפשרות Abstract מציגה את התמצית של המאמר והקישור האפשרי לטקסט המלא, אם הוא בעיתון שלנו או מוצע באופן חופשי.

    הדפסה: כל מאמר ניתן להדפסה מכל מחשב בספריה: על ידי שליחה להדפסה למדפסת שבקומת הכניסה.

  • שימו לב: בפורמט PDF יש ללחוץ על סמל המדפסת בתוכנת Acrobat Reader, ולא על סמל המדפסת של הדפדפן.

  • בהצלחה

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il


ad