I materiali biologici per l esame colturale tipologia ed importanza di un corretto prelievo
Download
1 / 51

I materiali biologici per l esame colturale: tipologia ed importanza di un corretto prelievo - PowerPoint PPT Presentation


  • 377 Views
  • Uploaded on

I materiali biologici per l’esame colturale: tipologia ed importanza di un corretto prelievo. Diagnostica Microbiologica delle Infezioni delle Basse Vie Respiratorie Firenze, 13 Marzo 2007. A. Raglio, A Grigis A.O. Ospedali Riuniti di Bergamo U.O. Microbiologia e Virologia

loader
I am the owner, or an agent authorized to act on behalf of the owner, of the copyrighted work described.
capcha
Download Presentation

PowerPoint Slideshow about 'I materiali biologici per l esame colturale: tipologia ed importanza di un corretto prelievo' - alijah


An Image/Link below is provided (as is) to download presentation

Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author.While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server.


- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - E N D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Presentation Transcript
I materiali biologici per l esame colturale tipologia ed importanza di un corretto prelievo
I materiali biologici per l’esame colturale: tipologia ed importanza di un corretto prelievo

Diagnostica Microbiologica delle Infezioni delle Basse Vie RespiratorieFirenze, 13 Marzo 2007

A. Raglio, A Grigis

A.O. Ospedali Riuniti di Bergamo

U.O. Microbiologia e Virologia

Direttore Dott A. Goglio


I temi
I temi importanza di un corretto prelievo

  • Il problema

  • Il nemico

  • L’importanza di un corretto prelievo

  • I materiali biologici

  • Criteri di idoneità


IL PROBLEMA importanza di un corretto prelievoLa polmonite acuta è fra le prime sei cause di morte ed è la più comune causa di mortalità correlata a infezione(Mandell 99)Tanti quadri cliniciTanti patogeniTanti materiali biologiciPoche diagnosiSolo nel 20-50% delle polmoniti comunitarie si riesce a raggiungere una diagnosi eziologicaMancanza di:- standardizzazione- test di riferimento (gold standard)


Cap principali patogeni isolati in corso di differenti studi di sorveglianza
CAP: Principali patogeni isolati in corso importanza di un corretto prelievodi differenti studi di sorveglianza

60

S. pneumoniae

H. influenzae

50

Legionella

40

Gram negativi

nessun patogeno

%

30

20

10

0

Rello 1996

Moine 1994

Feldman 1995

28/01


Il nemico 28 batteri 28 virus 10 funghi 2 rickettsie 5 mycoplasmi e chlamydie 5 parassiti

IL NEMICO importanza di un corretto prelievo28 Batteri28 Virus10 Funghi 2 Rickettsie 5 Mycoplasmi e Chlamydie 5 Parassiti

Mandell, Infectious Diseases, Fourth Edition


I microbi del cavo orale
I microbi del cavo orale importanza di un corretto prelievo

- Flora endogenadel cavo orale:10 15

1.

0

0

0.

0

0

0.

0

0

0.

0

0

0.

0

0

0


Flora naso-orofaringea importanza di un corretto prelievo

Opportunisti (raramente patogeni)- Str. - emolitici- S.coag.negativi- neisseriacee- Candide- Haemophilus spp- Actinobacillus spp- Anaerobi-………...

Normalmente non presenti:

- BGN (ferm. e non)

- Enterococchi

-…….

Ma nei pz intubati sì


Flora naso-orofaringea importanza di un corretto prelievo

Patogeni (stato di portatore sano)- S. aureus 35-40 %- N. meningitidis 5-15 %- S. pneumoniae 0-50 %- Haemophilus influenzae 5-20 %-………...


Infezioni comunitarie importanza di un corretto prelievo

Infanti-bambini:-> 80% virali:Influenza, RSV, adenovirus,…..- altre: Haemophilus, S. pneumoniae, S.aureusAdulti giovani:-> batteriche:M. pneumoniaeAdulti e anziani:- < 10-20% virali- altre:S. pneumoniae, Haemophilus, S.aureus e BGN fermentanti e non


Polmonite ospedaliera o nosocomiale importanza di un corretto prelievo

-La seconda I.O. per frequenza(27% di tutte le I.O.in TI)- Prevalentemente batterica - S. aureus (MSSA) - S. pneumoniae, H. influenzae-------------------------Enterobatteri - Bacilli GN non fermentanti - S. aureus (MRSA)- Elevata mortalità


Vap agenti eziologici in base al tempo cdc draft 2002

Early Onset Pneumonia EOP importanza di un corretto prelievo

E.coli

Klebsiella spp

Proteus spp

S.pneumoniae

H.influenzae

MSSA

Late Onset Pneumonia LOP

P.aeruginosa

BGN con ESBL

MRSA

Acinetobacter spp

……….

VAP: agenti eziologici in base al tempoCDC Draft 2002

NON Multi R

Spesso Multi R


Immunodepressi per importanza di un corretto prelievopatologia di base

- Fibrosi cistica: - P. aeruginosa (spesso mucoso) - Alcaligenes spp - B. cepacia - S. maltophilia - S. aureus - H. influenzae (anche non b) e S.pneumoniae - Aspergillus - Micobatteri spp


Il nemico
Il nemico importanza di un corretto prelievo

Occorre conoscerne:

  • la patogenicità e i meccanismi di virulenza

  • le caratteristiche colturali (esigenze nutritive, l’atmosfera di crescita, i tempi di crescita) e la carica per distinguerlo fra la flora contaminante

  • i determinanti antigenici

  • le sequenze identificative

  • le sensibilità ad antibiotici e disinfettanti


Oppure meglio l importanza di una interpretazione corretta in base al prelievo

L’importanza di un prelievo corretto importanza di un corretto prelievo

oppure meglio:L’importanza di una interpretazione corretta in base al prelievo


Contributo della microbiologia
Contributo della microbiologia importanza di un corretto prelievo

Diversamente da altre indagini strumentali e di laboratorio, la richiesta di indagini microbiologiche presenta aspetti peculiari:

il tipo e la qualità del campione condizionano in modo assoluto i risultati dell'indagine microbiologica,

l'invio del campione al microbiologo sottintende la domanda: "C'è qualcosa nel campione che può contribuire alla diagnosi ed alla terapia della malattia infettiva?"; ciò equivarrebbe ad inviare al Laboratorio di chimica clinica un campione di sangue "per ricerca di anormalità chimiche", senza ulteriore indicazione o precisazione


Contributo della microbiologia1
Contributo della microbiologia importanza di un corretto prelievo

Garbage in

Garbage out


Il manuale di raccolta
Il Manuale di raccolta importanza di un corretto prelievo

M&V

Ospedali Riuniti di Bergamo

PRELIEVO, CONSERVAZIONE ED INVIO

DEI CAMPIONI

PER INDAGINI MICROBIOLOGICHE

3a ed., maggio 2001, pag. 114

www.ospedaliriuniti.bergamo.it

Altri Manuali consultabili al sito: www.apsi.it


Iter dell indagine microbiologica
Iter dell’indagine microbiologica importanza di un corretto prelievo


Polmoniti campioni per la diagnosi eziologica
Polmoniti importanza di un corretto prelievoCampioni per la diagnosi eziologica

  • Materiali raccolti con metodiche protette, a bassa contaminazione

    • Lavaggio bronco-alveolare (BAL)

    • Lavaggio bronco-alveolare mirato con cateterino

    • Spazzolatura endobronchiale protetta (PSB)

  • Materiali ad alto rischio di contaminazione con saliva

    • Espettorato (o espettorato indotto o indotto-protetto)

    • Aspirato endotracheale / bronchiale / da tracheostomia

  • Altri materiali

    • Materiali bioptici

    • Liquido pleurico

    • Sangue (emocoltura, indagini sierologiche)

    • Succo gastrico (per micobatteri)

    • Tampone (aspirato) naso-faringeo (virus)

    • Urine (ricerca antigeni Legionella , Pneumococco)


  • Aspirato tracheo bronchiale
    Aspirato tracheo-bronchiale importanza di un corretto prelievo

    • Di semplice esecuzione, non richiede manovre invasive

    • La coltura identifica di solito il patogeno in causa (alta sensibilità), ma insieme ad altri microrganismi non responsabili dell’infezione (bassa specificità)

    • L’indagine microbiologica deve:

      • determinare la carica batterica (coltura quantitativa)

      • accompagnarsi all’esame microscopico (batteri e cellularità)

    Grossman R, Chest, 2000


    Aspirato tracheo bronchiale1
    Aspirato tracheo-bronchiale importanza di un corretto prelievo

    San Pedro, Chest, 2001


    Lavaggio broncoalveolare
    Lavaggio broncoalveolare importanza di un corretto prelievo

    • Procedura invasiva

    • Fattori che condizionano la “qualità” del BAL

      • competenza dell’esecutore

      • recupero > 10% della soluzione instillata

      • immediato invio alla microbiologia

      • terapia antibiotica in corso

    • Idoneità del campione

      • > 10 cellule per campo a x500

      • presenza di < 1% di celluleepiteliali

    Grossman R, Chest, 2000


    Prelievi protetti e risultati microbiologici

    Tecniche diagnostiche importanza di un corretto prelievo

    Sensibilità

    Specificità

    Valore predittivo Positivo

    Valore predittivo Negativo

    Colture PSB (>103 CFU/mL)

    82%

    89%

    90%

    89%

    Colture BAL (>104 CFU/mL)

    91%

    78%

    83%

    87%

    Esaminazione microscopica di fluidi da BAL (>5% organismi intracellulari)

    91%

    89%

    91%

    89%

    Tecniche diagnostiche

    Sensibilità

    Specificità

    Colture PSB(>103 CFU/mL)

    67%

    95%

    Colture BAL(>104 CFU/mL)

    73%

    82%

    Esaminazione microscopica di fluidi da BAL

    37-100%

    89-100%

    Prelievi “protetti” e risultati microbiologici

    Mayhall G., Emerging Infectious Diseases, 2001

    Grossman R., Chest, 2000

    Grosman R, Chest, 2000


    Infezioni delle basse vie respiratorie importanza di un corretto prelievo

    Possibilmente

    campioni protetti

    Solo se CAP grave:

    Espettorato o BroncoAsp

    Emocoltura

    (IDSA 2007)

    Solo campioni protetti:

    Broncolavaggio

    Spazzolatura

    Emocoltura (FADOI,’07)


    Diagnosi delle infezioni respiratorie importanza di un corretto prelievo

    - Più del 50% non sono diagnosticate- Non c’è un solo test per fare diagnosi - coltura secrezioni - emocoltura - ricerca antigeni (RSV, Legionella, S.pneumoniae, Aspergillus,…)- Per i batteri, spesso non è unproblema tecnico, ma diinterpretazione !!!!


    Diagnosi: due quesiti importanza di un corretto prelievo

    - Se isolo patogeni (spesso presenti anche nel cavo orale), sono quelli colonizzanti o sono quelli che hanno raggiunto il polmone?

    In pratica:Ho raccolto quelli del cavo orale o quelli dell’infezione ?


    Diagnosi: due quesiti importanza di un corretto prelievo

    - Se isolo non patogeni (normalmente non presenti nel cavo orale), sono quelli che hanno colonizzato il tratto respiratorio alto o hanno raggiunto anche il polmone?

    In pratica:Ho raccolto quelli delle alte vie o quelli dell’infezione ?


    Infezioni delle basse vie respiratorie importanza di un corretto prelievo

    La contaminazione con la flora del cavo orale inficia il risultato dell’esame colturale


    Campioni NON protetti importanza di un corretto prelievo

    Passano attraverso il cavo orale:- Espettorato (anche indotto, protetto)

    Raccolti con broncoscopio attraverso il cavo orale:- Lavaggio tracheo-bronchiale

    Raccolti con aspirazione: - durante la broncoaspirazione di intubati:- Aspirato tracheo-bronchiale- attraverso fistola tracheostomica:- Aspirato da tracheo-stomia


    Diagnosi importanza di un corretto prelievo

    Come evitare la raccolta dei colonizzanti?


    Campioni protetti importanza di un corretto prelievo

    - PSB= Brushing endo-bronchiale protetto- Mini-BAL= Lavaggio bronco-alveolare protetto

    - BAL= Lavaggio bronco-alveolare (più negli immuno-compromessi o polmoniti interstiziali)


    Vap diagnosi cdc draft 2002 gisig 1998
    VAP: Diagnosi importanza di un corretto prelievoCDC Draft 2002 -GISIG 1998

    • - i criteri tradizionali:

      • - clinici (tosse, febbre, leucocitosi, secrezioni purulente)

      • - strumentali (evidenze radiologiche di un infiltrato nuovo o progressivo)

      • - microbiologici (coltura dell’aspirato endotracheale, l.pleurico, sangue)

    • NON SONO SUFFICIENTI PER UNA VAP

  • PERCHE’ ASPECIFICI E INAFFIDABILI


  • Vap standardizzazione dei metodi diagnostici cdc draft 2002 gisig 1998
    VAP: Standardizzazione dei metodi diagnostici importanza di un corretto prelievoCDC Draft 2002 -GISIG 1998

    • - PSB (Protected Specimen Brush)

    • - BAL (Broncho-Alveolar Lavage)

    • - Mini-BAL (Protected Broncho-Alveolar Lavage)


    Criteri di idoneità importanza di un corretto prelievo

    Esame microscopico

    Cellule bronchiali epiteliali squamose

    Neutrofili

    Batteri intracellulari

    Flora Cavo Orale

    Semina

    Non Protetti con 1 mcl

    Protetti con 10 mcl

    Rilevazione cariche

    Non Protetti > 106 ucf/ml

    Broncolavaggio > 104 ucf/ml

    Mini-BAL > 102 ucf/ml

    Identificazione microrganismi

    Patogeni

    Non Patogeni


    Esame microscopico importanza di un corretto prelievo

    IdoneoNon idoneo


    Esame microscopico: Q-score importanza di un corretto prelievo

    Lettura: media di 10 campi


    Semina NON protetti importanza di un corretto prelievo

    Significative cariche >106 (10-100 UCF)


    Semina protetti importanza di un corretto prelievo

    Significative cariche >103 (1-10 UCF)(104 per BAL: 10-100 colonie)


    …e valutare il germe in causa importanza di un corretto prelievo

    Cioccolato 1l (diluito 1:10)

    - assenza crescita- 1 CFU = 104- 10 CFU = 105 - 100 CFU = 106 > 100 CFU = 107

    Patogeni

    Non Patogeni

    FBM

    ATB +ID

    descrittivo

    FBM


    Microrganismi respiratori
    Microrganismi respiratori importanza di un corretto prelievo

    Patogeni

    -BGN (fermentanti e non)-S. pneumoniae e beta-emolitici-S.aureus-Haemophilus influenzae-B.catarrhalis

    Non patogeni

    - S.coagulasi negativi- Strept. alfa-emolitici- Neisseriaceae- Altri Haemophilus


    Emocoltura
    Emocoltura importanza di un corretto prelievo

    20-30% polmoniti batteriche hanno batteriemia

    L’emocoltura dovrebbe essere sempre eseguita

    in caso di polmonite


    Collaborare per vedere i problemi per quel che sono importanza di un corretto prelievo


    Tenersi informati importanza di un corretto prelievo


    ad