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Medline 与 PubMed

第四章 外文医学文献检索工具. Medline 与 PubMed. 山西医科大学信息检索教研室. Medline & PubMed. Index Medcus(1879-2006) 印刷版 Medline(1969-) 国际联机 DIALOG Medline(1983-) 光盘版 PubMed(1997-) 网络版. 第一节 MEDLINE. 一、概况 收录范围： 1950 年至今 美国国立医学图书馆 (NLM) 世界权威的生物医学文献数据库

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Presentation Transcript

  1. 第四章 外文医学文献检索工具 Medline 与 PubMed 山西医科大学信息检索教研室

  2. Medline & PubMed • Index Medcus(1879-2006) 印刷版 • Medline(1969-) 国际联机DIALOG • Medline(1983-) 光盘版 • PubMed(1997-) 网络版

  3. 第一节 MEDLINE 一、概况 • 收录范围：1950年至今 • 美国国立医学图书馆(NLM) • 世界权威的生物医学文献数据库 • 70多个国家的3700多种期刊（中国50种）内容涉及生物医学各个领域 • 网络检索入口多

  4. 一、 概况 • 3种索引： • Index Medicus (医学索引) • Index to Dental Literature(牙科索引) • International Nursing Index(国际护理索引) • 除了不能进行分类和中文主题词途径检索外，其他与CBM(中国生物医学文献数据库)相似。

  5. 二、数据库结构 (数据库常用字段) • TI：Title 篇名 • AU：Authors 著者姓名 • AD：Address 著者地址 • SO：Source 文献出处（刊名，年卷期页） • PY：Publication Year 出版年 • AB：Abstract 文摘 • PT：PublicationType 出版类型 • MeSH: Medical Subject Headings 医学主题词

  6. 二、数据库结构 (数据库常用字段) • MJME： 主要主题词 • MIME： 次要主题词 • ISSN: International Standard Serial Number 国际标准连续出版号 • LA: Language of Article 文献语种 • CP: Country of Publication 出版国 • AN: Accession Number 登录号 • UD: Update Code 更新号

  7. 三、检索途径与方法 • 自由词检索（Searches） • 索引词检索（Index） • 主题词检索（Thesaurus） • 字段检索（Specific Fields） • 指定词检索（Add to Search） • 主题词提示检索（Suggest）

  8. 检索界面 索引检索 主题词检索 基本检索 主题词提示 工具按钮栏 检索区 检索历史区 其它功能 结果显示区 指定词检索

  9. 四、医学主题词表---MeSH • Medical Subject Headings • 使用CBM、Medline、PubMed的指南 • 用于医学主题词的规范 • 由字顺表和树状结构表组成 • 主题词约2万个，副主题词83个 • 动态性

  10. 按字顺排列 提供主题词、副主题词、分类号 注释及相关词 树状结构 部分词倒置，如KIDNEY FAILURE, ACUTE 帮助用户规范和了解主题词 字顺表（Alphabetic List)

  11. 主题词 树状结构号 注释与说明 相关检索词 副主题词 历史注释 树状结构

  12. 树状结构表（Tree Structrue ） • 根据词义范畴和学科属性排列 • 16类（解剖学、生物、疾病…) • 较好的体现了词间的隶属、平行、派生关系 • 一个主题词可有多个树状结构号 • 帮助用户查找规范主题词

  13. 第二节 PubMed 1、主办单位 美国国立医学图书馆(NLM) 2、收录学科内容 主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献。 包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学，基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。 2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。 2014/9/21 15

  14. 一、数据库概况 3、文献来源 全球70多个国家和地区 近5000种生物医学期刊 涉及40多个语种 47%为美国本土出版文献，90%为英文文献，79%的文献有著者撰写的英文文摘 2014/9/21 16

  15. 一、数据库概况 4、PubMed收录数据 • MEDLINE Indexed 1966 to prensent的MEDLINE已标引数据，有MeSH字段和摘要，每条记录标有 [PubMed-indexed for MEDLINE] • OldMDENLINE 1949-1965年间的MEDLINE数据，没有MeSH字段和摘要，每条记录标有 [PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966] 2014/9/21 17

  16. 一、数据库概况 4、PubMed收录数据 • MEDLINE Inprocess 最新的MDENLINE尚未标引的处理中数据。每条记录标有[PubMed-in process]。 • Not MEDLINE 是出版商提供的电子文献，PubMed 收录，而MDENLINE不收录的数据。每条记录标有[PubMed-as supplied by publisher]。 2014/9/21 18

  17. 5、主页介绍 高级检索 基本检索输入框 数据库选择 工具与资源：提供期刊数据库检索、规范词数据库检索、特定文献检索等 2014/9/21 19

  18. 可以在检索栏中输入一个或多个检索词（空格=AND）可以在检索栏中输入一个或多个检索词（空格=AND） 如：placenta growth oxygen 可以在检索栏中输入布尔逻辑运算式（运算符大写） 如：asthma AND (therapy OR treatment) 二、基本检索规则 2014/9/21 20

  19. 二、PubMed 基本检索规则 • 字段限定符：[ ]，按词组匹配 如：Stem cell transplantation[ti] • 截词符：treat* • 强迫短语检索符：“interleukin 2” 严格按输入形式匹配，不再自动转换匹配和扩展检索，常用于词组和专有名词检索。 2014/9/21 21

  20. 二、PubMed 基本检索规则 自动转换匹配检索词： 对常用医学名词进行自动在规范词索引、文本词及所有记录字段中转换匹配。 renal failure kidney failure [MESH] OR kidney[All Field] OR renal failure [All Field]…… 2014/9/21 22

  21. 二、PubMed 基本检索规则 自动扩展检索： 系统自动对主题词、副主题词扩展检索。 如：输入hypertension therapy，系统自动检索高血压的药物治疗（drug therapy）、饮食疗法(diet therapy) 2014/9/21 23

  22. 二、PubMed 基本检索规则 • 著者检索(authors)： • 姓全称在前，名缩写在后 • 加字段限定符 如： genbacev o[au] moore am[au] • 2002年以后的文章可以查著者全名 如：joshua lederberg [au] 2014/9/21 24

  23. 二、PubMed 基本检索规则 • 期刊检索（journals）： • 刊名全称检索 new england journal of medicine[so] • MEDLINE认可的标准刊名缩写检索 例：N Engl J Med[so] • 国际标准期刊号检索 例：0028-4793[so] 2014/9/21 25

  24. PubMed记录字段说明 文摘 第一著者单位地址 出版商提供文献识别号 著者群 版权说明 参考评论文献 合著者 文献参考评论 定稿版 校样版 输入日期 输入完成日期 电子出版日期 2014/9/21 26

  25. 电子出版日期 文献出版日期 数据加入PubMed日期 文献勘误 参考文献勘误 全部著者姓名 全部调研者姓名 作为文章主题的著者全称 文献相关注释 基金编号 基因符号 期编号 资助调研者 资助调研单位 国际标准期刊号 美国立医学图书馆识别号 期刊全称 2014/9/21 27

  26. 最后修订日期 规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘 版权拥有者 题录提供机构的识别号 病史相关与原始记录 其他关键词 提供其他关键词的机构 数据提供者机构 文章总页数 出版商提供数据时间 期刊出版国 数据库文献编号 2014/9/21 28

  27. 作为主题词的个人姓名 出版状态 文献类型 出版模式（纸张或电子） 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码 正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据 二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码 标准期刊缩写 文献标题 翻译标题 更新文献 文献正在更新 期刊卷号 2014/9/21 29

  28. 三、检索方法 1、基本检索 2、高级检索 3、MeSH数据库检索 4、期刊检索 5、临床咨询 2014/9/21 30

  29. 输入多个检索词 placenta growth oxygen 综述 免费全文 2014/9/21 31

  30. 字段限定 stem cell transplantation[ti] 2014/9/21 32

  31. stem cell[ti] AND transplantation[ti] 比空格多检出400篇 2014/9/21 33

  32. 自动转换匹配检索词 输入renal failure 2014/9/21 34

  33. 自动扩展检索 2014/9/21 35

  34. 著者检索 moore am[au] 2014/9/21 36

  35. 期刊检索: New england journal of medicine[so] 2014/9/21 37

  36. 2、高级检索 在一个网页中集基本检索、检索历史、多栏复合检索、索引查询、逻辑算符选择、检索限制于一体 检索史中显示历次检索式、时间和检出篇数 多栏复合检索时，检索框中只能输入检索词，不能输入检索式 利用字段限制和逻辑算符，构建复杂检索式 2014/9/21 39

  37. 检出篇数 检索式 检索时间 检索式编号可替代检索式进行输入检索如：#17 AND therapy 检索历史（Search History） 以列表形式显示历次检索式、检索时间和检出篇数 Preview:系统不显示命中文献信息，而在History中直接显示检索式和检出篇数。 2014/9/21 复旦大学图书馆文献检索教研室 40

  38. 多栏复合检索 查找Patrick Concannon于2009年发表在The New England Journal of Medicine上的综述。 栏间逻辑组配 栏内不能输算符，检索词间空格默认AND运算 concannon p 索引查询 2014/9/21 41

  39. 检索限制(Limit) 全文、免费全文、摘要限定 研究对象人/动物限制 性别限制 文献类型限制 语种限制 子文档限制 年龄限制 2014/9/21 42

  40. Limit — 检索限制 全文、免费全文、摘要限定 研究对象 人/动物限定 性别限定 语种限定 文献类型限定 子文档限定 年龄限定 2014/9/21 43

  41. 构建检索式

  42. 索引查询（Index） 2014/9/21 45

  43. Details （检索的详细匹配过程） 显示检索词转换匹配运算详细过程 用途：转换、确定规范词 如：liver cancer liver neoplasms 修改检索策略 2014/9/21 46

  44. 检索明细 数据库匹配过程 检索词转换 显示用户输入的检索式 2014/9/21 47

  45. 3、Mesh Database 确定规范化主题词 查看主题词词义注释 树状结构表 选择副主题词 扩展主题词 确定主要主题词检索（加权检索） 2014/9/21 48

  46. 进入 MeSH

  47. 检索实例1： 2006-09年有关舌根癌的治疗进展。 要求： 用MeSH Databse(主题词表选词)检索PubMed数据库，并用自由词检索09年以来发表的最新文献。 2014/9/21 50

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