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Coleção Brasileira de Microrganismos de Ambiente e Indústria

Coleção Brasileira de Microrganismos de Ambiente e Indústria. CBMAI Divisão de Recursos Microbianos CPQBA/UNICAMP drm@cpqba.unicamp.br. Locação Institucional. Divisão de Recursos Microbianos (DRM) CPQBA/UNICAMP Coord.: Gilson P. Manfio suporte financeiro UNICAMP FINEP/MCT FAPESP.

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Coleção Brasileira de Microrganismos de Ambiente e Indústria

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Presentation Transcript

  1. Coleção Brasileira de Microrganismos de Ambiente e Indústria CBMAI Divisão de Recursos Microbianos CPQBA/UNICAMP drm@cpqba.unicamp.br

  2. Locação Institucional • Divisão de Recursos Microbianos (DRM) • CPQBA/UNICAMP • Coord.: Gilson P. Manfio • suporte financeiro • UNICAMP • FINEP/MCT • FAPESP http://www.cpqba.unicamp.br

  3. Equipe • Gilson P. Manfio, Ph.D • sistemática microbiana • Valéria Maia de Oliveira, Dr. • biologia molecular, filogenia, caracterização molecular de bactérias • Mônica M. de Sillos Castro, Ms. • taxonomia e preservação de leveduras • Ana Paula M. Zibordi, Bióloga • taxonomia e preservação de fungos filamentosos • Patrícia M. Zachelo, Técnica • caracterização e preservação de microrganismos

  4. Escopo • Acervo • arqueas • bactérias • fungos filamentosos e leveduras • plasmídios • OGMs (certificação em andamento) • Grupo de risco • P1 e P2

  5. preservação depósito público segurança base de dados distribuição identificação taxonomia polifásica caracterização convencional e molecular tipagem treinamento pesquisa assessoria Atividades

  6. Preservação ultracongelador -80oC liofilizador centrífugo refrigeração 4oC (Castellani) N2 líquido (no projeto) Identificação/autenticação microscopia kits rápidos sistema de fotodocumentação digital PCR grupo-específico (termocicladores) sequenciador automático sistema de eletroforese de DNA Infra-estrutura

  7. Informática acesso à rede do CPQBA/UNICAMP servidor de rede do CBMAI (no projeto) Sistemas de Informação Intranet gerenciamento de solicitações e serviços BIS (Biodiversity Information System) dados de catálogo gerenciamento e manutenção do acervo informação associada Infra-estrutura

  8. Intranet CBMAI • Sistema integrado para o gerenciamento de solicitações de serviços • solicitação on-line de serviços, formulários • cadastro de clientes • andamento de serviços • resultados e relatórios • diário de bordo (avisos ligados à rotina) • rastreabilidade

  9. Coleção de Culturas

  10. Acervo • Bactérias: ~620 • Bacillus isolados de processos industriais: 200 • Actinomicetos de biomas brasileiros: 426 • Fungos filamentosos: 19 • Arqueas halofílicas: 6 • Culturas-referência para aplicação: 160 • normas ASTM, BS, ABNT • linhagens-tipo

  11. Biota/FAPESP Ecologia molecular de bactérias degradadores de xenobióticos Acidithiobacillus spp. bactérias endofíticas fixadores de nitrogênio Microrganismos endofíticos Microrganismos produtores de compostos bioativos CTPETRO Microrganismos associados a depósitos de petróleo Projetos Genoma Crinipellis perniciosa link para dados moleculares do Projeto Pesquisadores Indústrias Outras Coleções Ampliação do acervo

  12. BIS - Biodiversity Information System • dados básicos de catálogo • identificação, origem, depositante... • propriedades e aplicações • propriedades específicas • ambiente e indústria • aplicação em testes, ensaios e ensino • utilização em processos industriais • caracterização molecular • fingerprinting, seqüências • dados quimiotaxonômicos • informações confidenciais

  13. BIS - Tabelas básicas Espécies Linhagens Lotes de preservação Referências Meios de cultivo

  14. Código da espécie Tipo de organismo Gênero Espécie Variedade Descrição da variedade Autor Ano Referências bibliográficas Regulations Harzard group Observação Observações Taxonomia código da espécie referência Estado alternativo código da espécie morfologia Sinônimos código da espécie nomenclatura Tabela de espécies - campos

  15. Código da Linhagem Acesso (público ou restrito) Código da Espécie Patente Observações Depositada como – cód. espécie Data do depósito Status (ativo, inativo) Preservação Histórico (outras coleções) Depositante Nome e Código Data/Endereço Coletor Nome e Código Data/Endereço Identificador Nome e Código Data/Endereço Meio Crescimento Temperatura Observações Substrato Original Localização Geográfica Local e GPS Patogenicidade Referência Hospedeiro Nome Popular Gênero / Espécie / Variedade Referência Ecologia Referências Propriedades Produção de Metabólitos Degradação Dados Quimiotaxonômicos Dados Moleculares Dados Confidenciais Referências Tabelas de linhagens - campos

  16. Exemplo de registro no BIS • Bacillus sporothermodurans Petterson et al. 0087 Roza, C.R. (158-1)=CCT 7094.Milk UHT. GO, Brazil. Fing: BOX-PCR data. Tax: [023, 024, 025] Medium BHI; 37oC - FR

  17. 1 2 BOX-PCR fingerprint. Lanes: 1, DNA marker 100 bp ladder (Amersham Biosciences); 2, strain CBMAI 0087

  18. Exemplo de registro no BIS • CyclothyriumPetrak syn. Cytoplea Bizz. & Sacc. alt. Thyridaria Sacc. 0041 Silva, M. (FB41-6), 03/99 =CCT 6596 =CBS 109850. Estuary sediment [058]. Cubatão SP, Brazil.Degr: Degradation of pyrene, phenanthrene, anthracene, benzo[a]pyrene and bifenil [059]. Tolerant to pyrene [058]. Tax: [060] Medium MA2; 28oC - FR

  19. Exemplo de registro no BIS • Streptomyces Waksman & Henrici 0207 Sette, L.D. (LS182), 03/98. Soil contaminated with herbicide[130].Campinas SP, Brazil. Morphology: photo [130]. Seq: rDNA 16S. Degr: Degradation of alachlor herbicide[131]. Tax: [133, 134] Medium ISP3; 30oC - FR

  20. Optical microscopy 400X. Mycelium. Streptomyces sp. CBMAI 0207. Bennet’s Agar. 7 days, 30oC

  21. >CBMAI 0207 Streptomyces sp. rDNA 16S partial sequence 1 TAACAmskGGGGmAATTGcCCCTTCATTyTGGGACAAGCCCTgGaAAACG 51 GGGTCTAATACCGGATAACACTCTGTCCTGCATGGGACGGGGTTGAAAGC 101 TCCGGCGGTGAAGGATGAGCCCGCGGCCTATCAGCTTGTTGGTGGGGTAA 151 TGGCCTACCAAGGCGACGACGGGTAGCCgGCCTGAGAGGGCGACCGGCCA 201 CACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGA 251 ATATTGCACAATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCGACGCCGCGTGAGGGATG 301 ACGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTCAGCAGGGAAGAAGCGCAAGTGAC 351 GGTACCTGCAGAAGAAGCGCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAA 401 TACGTAGGGCGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTA 451 GGCGGCTTGTCACGTCGGATGTGAAAGCCCGGGGCTTAACCCCGGGTCTG 501 CATTCGATACGGGCTAGCTAGAGTGTGGTAGGGGAGATCGGAATTCCTGG 551 TGTAGCGGTGAAATGCGCAGATATCAGGAGGAACACCGGTGGCGAAGGCG 601 GATCTCTGGCCATTACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTkGGGAGCGAACA 651 GGrwTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGTTGGGaACTAGGTGTT 701 GCGACATTCCACGTCGTCGTGCCGCAGCTAACGCATTAAGTTCCCCGCCT 751 GGGAGTACGCCGCAAGGCTAAACTCAAAGGAATTGACgGGGGCCCGCACA 801 AGCAGCGGAGCATGTGGCTTAATTCGACGCAACGCGAAGAACCTTACCAA 851 GGCTTGACATATACCGGAAAGCATCAGAGATGGTGcCCCCCCTTGTGGTC 901 GGTATACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGhvmGATGTTGG 951 GTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTTCTGTGTTGCCAGCATGCCT 1001 TCGGGGTGATGGGGACTCACAGGAGACTGCCGGGGTCAACTCGGAGGAAG 1051 GTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTATGTCTTGGGCTGCACACG 1101 TGCTACAATGGCCGGTACAATGAGCTGCGAyGCCGCGAGGCGGAGCGAAT 1151 CTCAAAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTgGGGTCTGCAACTCGACCCCATG 1201 AAGTCGGAGTTGCTAGTAATCGCAGATCAGCATTGCT

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